RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HSF4Q9ULV5 492 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MGAT4AQ9UM21 535 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 EDARQ9UNE0 448 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.68□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AKAP9Q99996 3911 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0A6YYD4 124 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 M0QYG6 137 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AQP7O14520 342 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SOCS1O15524 211 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SSX5O60225 188 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CST4P01036 141 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR4E1P0C645 316 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PATE4P0C8F1 98 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM225BP0DP42 221 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 VSIG10L2P0DP72 767 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 S100A1P23297 94 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ANOS1P23352 680 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 AGTR1P30556 359 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ECI1P42126 302 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TAS2R31P59538 309 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 DHODHQ02127 395 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TGFBR3Q03167 851 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HGFACQ04756 655 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ARFRP1Q13795 201 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RSU1Q15404 277 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 C4orf46Q504U0 113 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SLC25A42Q86VD7 318 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HOGA1Q86XE5 327 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf62Q8N4C0 152 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC168Q8NDH2 2452 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR2AK2Q8NG84 335 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR5L1Q8NGL2 311 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR4K15Q8NH41 348 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FGFBP3Q8TAT2 258 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ST8SIA4Q92187 359 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SARAFQ96BY9 339 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CMBLQ96DG6 245 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SLC6A7Q99884 636 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 NICN1Q9BSH3 213 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 POFUT1Q9H488 388 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BANF2Q9H503 90 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GPR173Q9NS66 373 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 B3GNT2Q9NY97 397 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HSPB11Q9Y547 144 aa8.67□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 HLA-GP17693 338 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GMFBP60983 142 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RAB1AP62820 205 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF92Q03936 586 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GRK1Q15835 563 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 P4HA3Q7Z4N8 544 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 Q8NFD4 153 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 OR2AE1Q8NHA4 323 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 TERB2Q8NHR7 220 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 BOD1Q96IK1 185 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 POM121L2Q96KW2 1035 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 Q96M66 194 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 GPR137Q96N19 417 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 PECRQ9BY49 303 aa8.66□□□□□ -1.02
POLR1A-204ENST00000424089 CHST6Q9GZX3 395 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms