RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TK1P04183 234 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD33P20138 364 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RPS7P62081 194 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GINS1Q14691 196 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSX2Q16385 188 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM95Q3KNT9 176 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DNAL1Q4LDG9 190 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF684Q5T5D7 378 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEGS2Q6QHC5 323 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF573Q86YE8 665 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BBS1Q8NFJ9 593 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR51E1Q8TCB6 317 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIPC3Q8TF64 312 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MALSU1Q96EH3 234 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR8B4Q96RC9 309 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRIP2Q9BQI9 281 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MROQ9BYG7 248 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MUC13Q9H3R2 512 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR14J1Q9UGF5 321 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa10.61□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NXPH2O95156 264 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPIG6BO95866 241 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NRASP01111 189 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBP4P02753 201 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALDOBP05062 364 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGLL1P15814 213 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC2A5P22732 501 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNLT3P51808 116 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VAX1Q5SQQ9 334 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZS46 218 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DHFR2Q86XF0 187 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CPOQ8IVL8 374 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BATF2Q8N1L9 274 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TEAD3Q99594 435 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HES4Q9HCC6 221 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSCAML1Q8TD84 2053 aa10.6□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F2RL2O00254 374 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP6V1G2O95670 118 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HMGN1P05114 100 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HCCSP53701 268 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BLCAPP62952 87 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCN1P1Q5VSP4 162 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WFDC9Q8NEX5 89 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR11H6Q8NGC7 330 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 YIPF3Q9GZM5 350 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GPR173Q9NS66 373 aa10.59□□□□□ -0.71
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PRX2 142 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRR32B1ATL7 298 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7EIL1 84 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7N7A8 449 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF728P0DKX0 622 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV1-8P0DP01 117 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RAP2AP10114 183 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PF4V1P10720 104 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPZP25189 248 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL7A1Q02388 2944 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ROM1Q03395 351 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COL10A1Q03692 680 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOFQ13790 326 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLVS2Q5SYC1 327 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM42Q69YG0 159 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF679Q8IYX0 411 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTTY10Q9BZA0 68 aa10.58□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DLGAP1O14490 977 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF737O75373 536 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF254O75437 659 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CST1P01037 141 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TTRP02766 147 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OSMP13725 252 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RIDAP52758 137 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 EDDM3BP56851 147 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR12D2P58182 307 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERVK11-1P61568 191 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDK5Q00535 292 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CD83Q01151 205 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TCF23Q7RTU1 214 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF714Q96N38 554 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OCSTAMPQ9BR26 566 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MOB1AQ9H8S9 216 aa10.57□□□□□ -0.72
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IKZF2Q9UKS7 526 aa10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms