RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382723.4

MSX1-201, Transcript of msh homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MSX1, Length 1,939 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1-201ENST00000382723 F8VWA3 439 aa22.8■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 TRAPPC2LH3BP13 241 aa22.8■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 GABARAPH6UMI1 98 aa22.8■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 TPPPO94811 219 aa22.8■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 GNB3P16520 340 aa22.8■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 GUCA2AQ02747 115 aa22.8■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 MAB21L1Q13394 359 aa22.8■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 PIGYQ3MUY2 71 aa22.8■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 BEX5Q5H9J7 111 aa22.8■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 DEFA3P59666 94 aa22.79■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 ST3GAL6Q9Y274 331 aa22.78■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 SPRY3O43610 288 aa22.78■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 PLAUP00749 431 aa22.78■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa22.78■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 CYYR1Q96J86 154 aa22.78■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 HS3ST6Q96QI5 342 aa22.78■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 MEIS3P1A6NDR6 274 aa22.77■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 E7EQL1 145 aa22.77■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 C3orf80F5H4A9 247 aa22.77■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa22.77■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa22.77■■□□□ 1.24
MSX1-201ENST00000382723 ZNF581Q9P0T4 197 aa22.77■■□□□ 1.24
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MSX1-201ENST00000382723 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 UFSP2Q9NUQ7 469 aa22.76■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 A6NLC8 198 aa22.76■■□□□ 1.23
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MSX1-201ENST00000382723 ZNF81P51508 661 aa22.76■■□□□ 1.23
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MSX1-201ENST00000382723 MPPED2Q15777 294 aa22.76■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 OLFML2AQ68BL7 652 aa22.76■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa22.76■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 PLA2G10O15496 165 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 FCER2P06734 321 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 KIR2DL3P43628 341 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 RBM11P57052 281 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 GMFBP60983 142 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 ZNF826PQ6ZT77 177 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 IL36RNQ9UBH0 155 aa22.75■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
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MSX1-201ENST00000382723 SERPINF1P36955 418 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 FGF12P61328 243 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 MZT1Q08AG7 82 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 TRIM16LQ309B1 348 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 ELP2Q6IA86 826 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 CENPSQ8N2Z9 138 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 TOMM5Q8N4H5 51 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 Q8NFD4 153 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 SETD6Q8TBK2 473 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 SEH1LQ96EE3 360 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 KCNK7Q9Y2U2 307 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 ASAH1Q13510 395 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 C11orf53Q8IXP5 236 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 CHPT1Q8WUD6 406 aa22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 C19orf84I3L1E1 186 aa22.73■■□□□ 1.23
MSX1-201ENST00000382723 DNM1P46Q6ZS02 220 aa22.73■■□□□ 1.23
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