RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GTL3 188 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CGB1A6NKQ9 187 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 B4DEV8 164 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A4O95047 310 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 HRH1P35367 487 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RUNX1Q01196 453 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DOK6Q6PKX4 331 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR135Q8IZ08 494 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OSR2Q8N2R0 312 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5B3Q8NH48 314 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FGGYQ96C11 551 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR2A7Q96R45 310 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT22Q9BRQ3 303 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A51Q9H1U9 297 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TM7SF3Q9NS93 570 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa5.97□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DCTN6O00399 190 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FUT3P21217 361 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIR2DS4P43632 304 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 REG1BP48304 166 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PDGFRLQ15198 375 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5D16Q8NGK9 328 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM163Q8TC26 289 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF138Q8WVD3 245 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PIGCQ92535 297 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 FCGR1BQ92637 280 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A46Q96AG3 418 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IFNA1P01562 189 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 ADH4P08319 380 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 EN2P19622 333 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HTR1EP28566 365 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC6A9P48067 706 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CAV2P51636 162 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DLK1P80370 383 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TP53I3Q53FA7 332 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CRB2Q5IJ48 1285 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHDC9Q8NEP7 349 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10G4Q8NGN3 311 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5P2Q8WZ92 322 aa5.96□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KLHL13Q9P2N7 655 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MTCL1Q9Y4B5 1905 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PTPRJQ12913 1337 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MFNGO00587 321 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TAX1BP3O14907 124 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 DEGS1O15121 323 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 EEDO75530 441 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 CT62P0C5K7 136 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 F2RP25116 425 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 C4orf48Q5BLP8 95 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HMGN2P46Q86SG4 172 aa5.96□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 SAMD12Q8N8I0 201 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR51G2Q8NGK0 314 aa5.96□□□□□ -1.46
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RABGEF1-202ENST00000380828 OR52I2Q8NH67 350 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 OR56B4Q8NH76 319 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 MFSD8Q8NHS3 518 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF141Q8WVD5 230 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 KIRREL1Q96J84 757 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TUBB1Q9H4B7 451 aa5.96□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 HTTP42858 3142 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 CDC14CA4D256 554 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 SHISA7A6NL88 538 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 RAMP1O60894 148 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLC1P0CG04 106 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 TYRP14679 529 aa5.95□□□□□ -1.46
RABGEF1-202ENST00000380828 IMPA1P29218 277 aa5.95□□□□□ -1.46
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