RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361716.7

VAMP1-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP1, Length 3,449 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1-201ENST00000361716 FAM24AA6NFZ4 105 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TGOLN2O43493 480 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 NPSP0C0P6 89 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 OR5H8P0DN80 308 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 MYF5P13349 255 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FUT3P21217 361 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 NUBP1P53384 320 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 RAB4BP61018 213 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 RUNX1Q01196 453 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GAB4Q2WGN9 574 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 NT5CQ8TCD5 201 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 NDUFAF3Q9BU61 184 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CCDC187A0A096LP49 1063 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 RAD51DO75771 328 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PTGER4P35408 488 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GFERP55789 205 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ERVS71-1P61550 626 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FAM3AP98173 230 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GPR157Q5UAW9 335 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF524Q96C55 264 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 MALSU1Q96EH3 234 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 LAMP3Q9UQV4 416 aa11.21□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 A8MWP6 167 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 DFFBO76075 338 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PMELP40967 661 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 MMP16P51512 607 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 BRICD5Q6PL45 260 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF66Q6ZN08 573 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 METTL9Q9H1A3 318 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 UCK1Q9HA47 277 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PRSS37A4D1T9 235 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 M0R143 59 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TMEM225BP0DP42 221 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FCARP24071 287 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FPR2P25090 351 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 SFTPDP35247 375 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GNMTQ14749 295 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CEBPEQ15744 281 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ADIRFQ15847 76 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PRTGQ2VWP7 1150 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CST9LP1Q5W188 147 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FAM166AQ6J272 317 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 LCN15Q6UWW0 184 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 OR5D14Q8NGL3 314 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 LMX1AQ8TE12 382 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 SNHG12Q9BXW3 62 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 RTN4RQ9BZR6 473 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PTPRSQ13332 1948 aa11.2□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TCF21O43680 179 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 OR4A8P0C604 315 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GZMBP10144 247 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FOLR1P15328 257 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CDAP32320 146 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 EGR4Q05215 589 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 OR52N5Q8NH56 324 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 C9J4A7 227 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 F5H5K5 113 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GPR137BO60478 399 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 DEDDO75618 318 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF117Q03924 483 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TLE3Q04726 772 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TOMM20Q15388 145 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PHF19Q5T6S3 580 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 Q7L0L9 218 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 CATSPERDQ86XM0 798 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF283Q8N7M2 679 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 M1APQ8TC57 530 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 GDE1Q9NZC3 331 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 A0A1W2PR80 420 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 HLA-HP01893 362 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 PIGPP57054 158 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 BTNL3Q6UXE8 466 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 C1QL4Q86Z23 238 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ESPL1Q14674 2120 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa11.19□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa11.18□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.18□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 H3BP45 60 aa11.18□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 ZNF217O75362 1048 aa11.18□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.18□□□□□ -0.62
VAMP1-201ENST00000361716 RRADP55042 308 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms