RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 DUX4Q9UBX2 424 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 AASSQ9UDR5 926 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 HHLA2Q9UM44 414 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SGMS1-201ENST00000361543 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM89A2RUT3 159 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF732B4DXR9 585 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY10O00398 339 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB3O43676 98 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RHBDL1O75783 438 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CD2P06729 351 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OCM2P0CE71 109 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SELLP14151 372 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MMP9P14780 707 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF20P17024 532 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR12D2P58182 307 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BPIFB3P59826 476 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 IL13RA1P78552 427 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRR20EP86478 221 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRR20CP86479 221 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRR20DP86480 221 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRR20BP86481 221 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRR20AP86496 221 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BDH1Q02338 343 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TP53I3Q53FA7 332 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DMRTC1Q5HYR2 192 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZSR3 168 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MOB3CQ70IA8 216 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SSX6Q7RTT6 188 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF573Q86YE8 665 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf56Q8N813 242 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR5T2Q8NGG2 359 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PPP1R14AQ96A00 147 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLC25A28Q96A46 364 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PELI1Q96FA3 418 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GAFA1Q96PS6 74 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SIRPDQ9H106 197 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DNTTIP1Q9H147 329 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR51I2Q9H344 312 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SNTG1Q9NSN8 517 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.33□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GTI1 187 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR2AT4A6NND4 320 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CLDN34H7C241 214 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 SLC1A7O00341 560 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DENRO43583 198 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 RGS10O43665 173 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 NRASP01111 189 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TFF1P04155 84 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CDK1P06493 297 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LIMS3P0CW19 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LIMS4P0CW20 117 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 HKR1P10072 659 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 AMY2BP19961 511 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PRKACBP22694 351 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 GLRA1P23415 457 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ARF6P62330 175 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD1Q15116 288 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ODF4Q2M2E3 257 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 AWAT1Q58HT5 328 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM42Q69YG0 159 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LAIR2Q6ISS4 152 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 AHSA2Q719I0 299 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.32□□□□□ -1.4
SGMS1-201ENST00000361543 OR5AK2Q8NH90 309 aa6.32□□□□□ -1.4
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