RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000334414.10

PTPRB-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 12,316 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-202ENST00000334414 A0A0B4J2E0 115 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 A0A1B0GX12 115 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 DHRS7CA6NNS2 312 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 HS3ST1O14792 307 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 GPR37O15354 613 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 PPICP45877 212 aa4.96□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 CLN8Q9UBY8 286 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 FUT9Q9Y231 359 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 A0A1B0GV90 55 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ZNF253O75346 499 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 DAPP1Q9UN19 280 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 NDUFS8O00217 210 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 TTRP02766 147 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 ACP1P24666 158 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 DNLZQ5SXM8 178 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 TMEM215Q68D42 235 aa4.95□□□□□ -1.62
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PTPRB-202ENST00000334414 OR5A1Q8NGJ0 315 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 CHODLQ9H9P2 273 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 IL17BQ9UHF5 180 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 A0A087WWC5 75 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 OR2W5A6NFC9 320 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 PPP6CO00743 305 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 SOCS7O14512 581 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 B3GALT4O96024 378 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 RPS20P60866 119 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-202ENST00000334414 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
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