RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 TLE3Q04726 772 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RSU1Q15404 277 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SLC22A25Q6T423 547 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR5L2Q8NGL0 311 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TVP23CQ96ET8 276 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 BOD1Q96IK1 185 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ANKUB1A6NFN9 424 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PHOX2AO14813 284 aa9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 OR5H8P0DN80 308 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HOXB2P14652 356 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 BTF3P20290 206 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RND2P52198 227 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LSM6P62312 80 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CLEC9AQ6UXN8 241 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TTLL10Q6ZVT0 673 aa9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 FBXL14Q8N1E6 418 aa9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 S100PBPQ96BU1 408 aa9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 RHOVQ96L33 236 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ANGPTL4Q9BY76 406 aa9.86□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ALKBH4Q9NXW9 302 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 B3GAT1Q9P2W7 334 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa9.86□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LIPT2A6NK58 231 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF727A8MUV8 499 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 PITX3O75364 302 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CD63P08962 238 aa9.85□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 GIMD1P0DJR0 217 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 DTYMKP23919 212 aa9.85□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 C9orf50Q5SZB4 431 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 DPPA3Q6W0C5 159 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LYZL2Q7Z4W2 148 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF429Q86V71 674 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LGI3Q8N145 548 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SLC38A9Q8NBW4 561 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TSLPQ969D9 159 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 LIME1Q9H400 295 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 SERINC1Q9NRX5 453 aa9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa9.85□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GX30 115 aa9.84□□□□□ -0.83
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GINS3-202ENST00000328514 DIRAS3O95661 229 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CDS2O95674 445 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF728P0DKX0 622 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CEACAM1P13688 526 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 OR1D4P47884 311 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 UCP3P55916 312 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 HAGHQ16775 308 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 ZNF343Q6P1L6 599 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 BEND4Q6ZU67 534 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 COMMD2Q86X83 199 aa9.84□□□□□ -0.83
GINS3-202ENST00000328514 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.84□□□□□ -0.83
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