RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 Q8NFD4 153 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TECTBQ96PL2 329 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PRDM14Q9GZV8 571 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TUBD1Q9UJT1 453 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NRASP01111 189 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 IFNA2P01563 188 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 LCATP04180 440 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PATE4P0C8F1 98 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF92Q03936 586 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SIGLEC14Q08ET2 396 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RAB32Q13637 225 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SMUG1Q53HV7 270 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ELP2Q6IA86 826 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 OR51F2Q8NH61 342 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 POM121Q96HA1 1249 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TAAR9Q96RI9 348 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHB10Q9UN67 800 aa11.95□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NEURL1O76050 574 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PMELP40967 661 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RSU1Q15404 277 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PXDC1Q5TGL8 231 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 Q6ZPA2 131 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 OR10AD1Q8NGE0 317 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ABHD3Q8WU67 409 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SMOC1Q9H4F8 434 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 C1orf123Q9NWV4 160 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 GDF1P27539 372 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FUT6P51993 359 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SPEM2Q0P670 501 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 BTN1A1Q13410 526 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TAF9Q16594 264 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 BPIFCQ8NFQ6 507 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 BORCS8Q96FH0 119 aa11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 C9orf172C9J069 976 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF587BE7ETH6 402 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 XRCC2O43543 280 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PET100P0DJ07 73 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 LHX2P50458 406 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NKAPLQ5M9Q1 402 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ATRAIDQ6UW56 229 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 MARC2Q969Z3 335 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TAS2R3Q9NYW6 316 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 C10orf91Q5T1B1 145 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 GALNT14Q96FL9 552 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 WDFY4Q6ZS81 3184 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SFTPBP07988 381 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 OR5H8P0DN80 308 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF708P17019 499 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CLDN18P56856 261 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 MST1LQ2TV78 715 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 OSR2Q8N2R0 312 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 LRTM2Q8N967 370 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NECAP2Q9NVZ3 263 aa11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 HKR1P10072 659 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PRSS12P56730 875 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 PIGYQ3MUY2 71 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RAB11FIP2Q7L804 512 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 OR2M7Q8NG81 312 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TCEAL3Q969E4 200 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 NUDT19A8MXV4 375 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TRAPPC6AO75865 159 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CDCP2Q5VXM1 449 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 CCDC36Q8IYA8 594 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RNF141Q8WVD5 230 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 SLC6A15Q9H2J7 730 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 BCO1Q9HAY6 547 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 LRFN1Q9P244 771 aa11.92□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 KNG1P01042 644 aa11.91□□□□□ -0.5
ATG4C-201ENST00000317868 RRADP55042 308 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms