RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299194.5

LRTM2-201, Transcript of leucine rich repeats and transmembrane domains 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LRTM2, Length 3,688 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRTM2-201ENST00000299194 FBXW12Q6X9E4 464 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 Q6ZRG5 221 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 LYZL2Q7Z4W2 148 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SVBPQ8N300 66 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM217Q8N7C4 229 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 MARVELD3Q96A59 401 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 FOXB1Q99853 325 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ATG12O94817 140 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 APOC1P02654 83 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SLC25A4P12235 298 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 CBX5P45973 191 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 MALLQ13021 153 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 IKZF1Q13422 519 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 IGFBP7Q16270 282 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SLC23A3Q6PIS1 610 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 HES7Q9BYE0 225 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM218A2RU14 115 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 WRBO00258 174 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TSPAN15O95858 294 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 MELTFP08582 738 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 COX6A1P12074 109 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TBPP20226 339 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SPATA46Q5T0L3 261 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 LHFPL5Q8TAF8 219 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 HAS2Q92819 552 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SLC5A7Q9GZV3 580 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 FBXL17Q9UF56 701 aa11.32□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 C5orf49A4QMS7 147 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 VAMP5O95183 116 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 CAMLGP49069 296 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 CYB561P49447 251 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 OR6S1Q8NH40 331 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 FGFBP3Q8TAT2 258 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PP6455Q8WZ26 134 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 CHST5Q9GZS9 411 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 LDAHQ9H6V9 325 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 RHOFQ9HBH0 211 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 LRFN1Q9P244 771 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 GLS2Q9UI32 602 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 MUC3AQ02505 3323 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 HS3ST1O14792 307 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 RAC1P63000 192 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ZNF92Q03936 586 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 OR2Y1Q8NGV0 311 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 FRYQ5TBA9 3013 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 A0A1W2PR80 420 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 CBR1P16152 277 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 P4HA3Q7Z4N8 544 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 RDH5Q92781 318 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 DNTTIP1Q9H147 329 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ANXA10Q9UJ72 324 aa11.31□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PRR14LQ5THK1 2151 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 GJE1A6NN92 205 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 IL2RAP01589 272 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 DAOP14920 347 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 HAAOP46952 286 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 FHITP49789 147 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 TMEM33P57088 247 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ACER2Q5QJU3 275 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 DCAF12Q5T6F0 453 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 OR52H1Q8NGJ2 320 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 RAB18Q9NP72 206 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 DOCK10Q96BY6 2186 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 SERPINE3A8MV23 424 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 HSD17B6O14756 317 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 ONECUT2O95948 504 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 GPM6AP51674 278 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 PSG4Q00888 419 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 OR8U9P0C7N5 309 aa11.3□□□□□ -0.6
LRTM2-201ENST00000299194 NPBWR2P48146 333 aa11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms