RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 B9A039 149 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 AADACP22760 399 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 BVESQ8NE79 360 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 C16orf52Q8NHV5 167 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 PHYHIPQ92561 330 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 TM4SF18Q96CE8 201 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 PMCHP20382 165 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 DHRS11Q6UWP2 260 aa6.97□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 CCDC190Q86UF4 302 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 SH3BGRL3Q9H299 93 aa6.97□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 J3KTA2 159 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 SLC25A30Q5SVS4 291 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 FAHD1Q6P587 224 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 CBLN2Q8IUK8 224 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 RDH5Q92781 318 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.96□□□□□ -1.29
USP3-201ENST00000268049 DUSP21Q9H596 190 aa6.96□□□□□ -1.29
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USP3-201ENST00000268049 M0R135 149 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 TAPBPO15533 448 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 CD14P08571 375 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 STAG3L2P0CL84 134 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 CSRP3P50461 194 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 MTURNQ8N3F0 131 aa6.96□□□□□ -1.3
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USP3-201ENST00000268049 MARVELD3Q96A59 401 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 VWCEQ96DN2 955 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ZNF799Q96GE5 643 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 OR2A5Q96R48 311 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 SGPP1Q9BX95 441 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 A0A1B0GV72 72 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 M0R1X1 148 aa6.96□□□□□ -1.3
USP3-201ENST00000268049 ST8SIA3O43173 380 aa6.96□□□□□ -1.3
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