RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264779.6

GPBP1-201, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 1,786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-201ENST00000264779 TRAPPC2LH3BP13 241 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 C15orf65H3BRN8 121 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 K7EQD1 137 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 GYG2O15488 501 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 PPIHO43447 177 aaKnown RBP2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 MBTPS2O43462 519 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 SSNA1O43805 119 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 SOX15O60248 233 aa2.39□□□□□ -2.03
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GPBP1-201ENST00000264779 TPST1O60507 370 aa2.39□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP2.39□□□□□ -2.03
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GPBP1-201ENST00000264779 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.38□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.38□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 ZNF878C9JN71 531 aa2.38□□□□□ -2.03
GPBP1-201ENST00000264779 PPP5D1E7EU14 171 aa2.38□□□□□ -2.03
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