RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 S100A9P06702 114 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 PMELP40967 661 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 P2RY1P47900 373 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 CAMLGP49069 296 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 Q6ZSR3 168 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 GJC3Q8NFK1 279 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 TOMM40LQ969M1 308 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 NAA60Q9H7X0 242 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 ZNF581Q9P0T4 197 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 LUZP4Q9P127 313 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 MYOTQ9UBF9 498 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-201ENST00000263233 XRCC2O43543 280 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GPR137BO60478 399 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 C1QL1O75973 258 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 DIRAS3O95661 229 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GLP1RP43220 463 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 LYZL2Q7Z4W2 148 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 KMT5CQ86Y97 462 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 LRRC18Q8N456 261 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 OR5L2Q8NGL0 311 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 HPSE2Q8WWQ2 592 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SLC39A7Q92504 469 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 NELFAQ9H3P2 528 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 C19orf12Q9NSK7 152 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 AK3Q9UIJ7 227 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PR64 198 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 A0A1W2PRV1 198 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 TIAF1O95411 115 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 DBHP09172 617 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GLB1P16278 677 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 RAB5AP20339 215 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 LMO1P25800 156 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 OPRM1P35372 400 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 WDSUB1Q8N9V3 476 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GNRHR2Q96P88 292 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GPR173Q9NS66 373 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 MED12Q93074 2177 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 UMAD1C9J7I0 102 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ANGPTL7O43827 346 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 IGHV2-5P01817 119 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZNF728P0DKX0 622 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 TSC22D1Q15714 1073 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 TAF9Q16594 264 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 TSPO2Q5TGU0 170 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SMRP1Q8NCR6 262 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 TCEAL3Q969E4 200 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 NABP1Q96AH0 204 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GALNT14Q96FL9 552 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 NIT2Q9NQR4 276 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 NECAP2Q9NVZ3 263 aa13.01□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZNF850A8MQ14 1090 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 CSNK1A1P48729 337 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SLC35A1P78382 337 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 PLXDC2Q6UX71 529 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 FAM24BQ8N5W8 94 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 OR52M1Q8NGK5 317 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 C18orf12Q96KH6 178 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 H7C1Q1 480 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 M0R135 149 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZFAND5O76080 213 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ARG1P05089 322 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SULT1A1P50225 295 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 MTCP1P56278 107 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 HIST1H3AP68431 136 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SNAI3Q3KNW1 292 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 C10orf128Q5T292 105 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 GPR157Q5UAW9 335 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 HIST2H3AQ71DI3 136 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 RABEPKQ7Z6M1 372 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 ZNF799Q96GE5 643 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 RSRP1Q9BUV0 290 aa13□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 RTTNQ86VV8 2226 aa12.99□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 PRH1P02810 166 aa12.99□□□□□ -0.33
SYP-201ENST00000263233 OR8U8P0C7N1 319 aa12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms