RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258962.4

SRSF1-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF1, Length 1,513 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF1-201ENST00000258962 SOCS1O15524 211 aa14.9□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 MPV17P39210 176 aa14.9□□□□□ -0.02
SRSF1-201ENST00000258962 NAAAQ02083 359 aa14.9□□□□□ -0.02
SRSF1-201ENST00000258962 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.9□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 ALKBH6Q3KRA9 238 aa14.9□□□□□ -0.02
SRSF1-201ENST00000258962 C3orf36Q3SXR2 165 aa14.9□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 C22orf34Q6ZV56 151 aa14.9□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 S100A13Q99584 98 aa14.9□□□□□ -0.02
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SRSF1-201ENST00000258962 SULT1C2O00338 296 aa14.89□□□□□ -0.03
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SRSF1-201ENST00000258962 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
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SRSF1-201ENST00000258962 TRAPPC2BP0DI82 140 aa14.88□□□□□ -0.03
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SRSF1-201ENST00000258962 RSU1Q15404 277 aa14.87□□□□□ -0.03
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SRSF1-201ENST00000258962 ZNF611Q8N823 705 aa14.87□□□□□ -0.03
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SRSF1-201ENST00000258962 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 SLC25A26Q70HW3 274 aa14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 UPRTQ96BW1 309 aa14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 RAB3CQ96E17 227 aa14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 TUBG2Q9NRH3 451 aa14.87□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SRSF1-201ENST00000258962 OR5B21A6NL26 309 aa14.86□□□□□ -0.03
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