RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 SHEQ5VZ18 495 aa6.99□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 TMEM65Q6PI78 240 aa6.99□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.99□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 MIOXQ9UGB7 285 aa6.99□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 PIEZO1Q92508 2521 aa6.99□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 OOEPA6NGQ2 149 aa6.99□□□□□ -1.29
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NANOG-201ENST00000229307 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
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NANOG-201ENST00000229307 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa6.98□□□□□ -1.29
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NANOG-201ENST00000229307 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.98□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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NANOG-201ENST00000229307 KCNK17Q96T54 332 aa6.98□□□□□ -1.29
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NANOG-201ENST00000229307 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.98□□□□□ -1.29
NANOG-201ENST00000229307 ALDH3B2P48448 385 aa6.98□□□□□ -1.29
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NANOG-201ENST00000229307 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
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