RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 R4GMQ9 66 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PCMT1P22061 227 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DUSP8Q13202 625 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HDAC8Q9BY41 377 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HS3ST2Q9Y278 367 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PRRG2O14669 202 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PTGESO14684 152 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SCRG1O75711 98 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LIPFP07098 398 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 AESQ08117 197 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF273Q14593 569 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR2W3Q7Z3T1 314 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OOEPA6NGQ2 149 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 AQP7P3A6NL99 342 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 P01737 135 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GP1BAP07359 652 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 DIO1P49895 249 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR1D5P58170 312 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PFN3P60673 137 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 VWA2Q5GFL6 755 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF519Q8TB69 540 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HS3ST1O14792 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FUT6P51993 359 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LCN15Q6UWW0 184 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CAMKMTQ7Z624 323 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ST8SIA1Q92185 356 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PDXPQ96GD0 296 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GABRG3Q99928 467 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM38BQ9NVV0 291 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 H3BNC9 293 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 HMGN4O00479 90 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SPNP16150 400 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 IL21Q9HBE4 155 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TLCD2A6NGC4 264 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C1SP09871 688 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 IQCF3P0C7M6 154 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TCL1AP56279 114 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPNMBQ14956 572 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CDK5R1Q15078 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SHBQ15464 509 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 PARM1Q6UWI2 310 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NPEPL1Q8NDH3 523 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 BVESQ8NE79 360 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR1N1Q8NGS0 311 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SCMH1Q96GD3 660 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CRYAAP02489 173 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CCL5P13501 91 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT11Q96G61 164 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 MARVELD1Q9BSK0 173 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NAGKQ9UJ70 344 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO4Q9UKT5 387 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR5AC1P0C628 307 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FPR2P25090 351 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 SLC19A1P41440 591 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM268Q5VZI3 342 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NHLRC1Q6VVB1 395 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 STAC2Q6ZMT1 411 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TPSD1Q9BZJ3 242 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 FAM117AQ9C073 453 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 S1PR5Q9H228 398 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 TXNRD2Q9NNW7 524 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 NDUFB6O95139 128 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 GPR137Q96N19 417 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 UQCC1Q9NVA1 299 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 QDPRP09417 244 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 RGRP47804 291 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 CLDN15P56746 228 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 USP53Q70EK8 1073 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LINC00596Q86U02 117 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 LRRTM3Q86VH5 581 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-209ENST00000612229 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.3□□□□□ -1.4
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