RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MSGN1A6NI15 193 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FIGNL2A6NMB9 653 aa10.26□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FPR2P25090 351 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R31P59538 309 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF92Q03936 586 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RSU1Q15404 277 aa10.26□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBEAQ8NFP9 2946 aa10.26□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 M6PRP20645 277 aa10.26□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SSPNQ14714 243 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIGYQ3MUY2 71 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ACTBL2Q562R1 376 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OR51F2Q8NH61 342 aa10.26□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TM2D1Q9BX74 207 aa10.26□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 WNT5BQ9H1J7 359 aa10.26□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0B4J2A0 478 aa10.25□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERPINE3A8MV23 424 aa10.25□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV1D-12P01611 117 aa10.25□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PPZ6 126 aa10.25□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SFTPBP07988 381 aa10.25□□□□□ -0.77
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HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CCNOP22674 350 aa10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CBX5P45973 191 aa10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R46P59540 309 aa10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPO2Q5TGU0 170 aa10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SULF2Q8IWU5 870 aa10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GPR35Q9HC97 309 aa10.25□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LNP1A1A4G5 178 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TSPAN4O14817 238 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NRASP01111 189 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GP1BAP07359 652 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MPLP40238 635 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GFRA1P56159 465 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCRN3Q0VDG4 424 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CDCP2Q5VXM1 449 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZSR3 168 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MOB3CQ70IA8 216 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PIGCQ92535 297 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BORCS8Q96FH0 119 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SULT4A1Q9BR01 284 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TAS2R3Q9NYW6 316 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 AK3Q9UIJ7 227 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM166BA8MTA8 275 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGHEP01854 428 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APOC3P02656 99 aa10.24□□□□□ -0.77
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPINK2P20155 84 aa10.24□□□□□ -0.77
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