RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602498.1

HCG18-243, Transcript of HLA complex group 18, human

TSL 3 BASIC

Gene HCG18, Length 327 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCG18-243	ENST00000602498	C9orf139	Q6ZV77	190 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CALHM1	Q8IU99	346 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CD177	Q8N6Q3	437 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RFT1	Q96AA3	541 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RNFT2	Q96EX2	444 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SPACA5	Q96QH8	159 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MBOAT4	Q96T53	435 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF747	Q9BV97	191 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C1RL	Q9NZP8	487 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		V9GYS6	101 aa		4.65	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR5B21	A6NL26	309 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498		J3QT63	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	GPR137B	O60478	399 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF254	O75437	659 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PAH	P00439	452 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	KNG1	P01042	644 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IGLV3-1	P01715	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PGA5	P0DJD9	388 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CPT2	P23786	658 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PRDX2	P32119	198 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SAA4	P35542	130 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	BMX	P51813	675 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	EDDM3B	P56851	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CDC42	P60953	191 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACTR3	P61158	418 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	COL10A1	Q03692	680 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	EGR3	Q06889	387 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	EDDM3A	Q14507	147 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF273	Q14593	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PDCD1	Q15116	288 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SNCB	Q16143	134 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TAF9	Q16594	264 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TUSC1	Q2TAM9	212 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ATPAF1	Q5TC12	328 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C17orf107	Q6ZR85	190 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	POC1A	Q8NBT0	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	FGGY	Q96C11	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SLC29A1	Q99808	456 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	CHST6	Q9GZX3	395 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	PPA2	Q9H2U2	334 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ABCB9	Q9NP78	766 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.64	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	DAPL1	A0PJW8	107 aa		4.63	□□□□□ -1.67
HCG18-243	ENST00000602498	TMEM82	A0PJX8	343 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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