RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBTB37Q5TC79 503 aa20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF561Q8N587 486 aa20.72■□□□□ 0.91
CAPNS1-211ENST00000590874 DTX3Q8N9I9 347 aa20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 PHF21AQ96BD5 680 aa20.72■□□□□ 0.91
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR4F4Q96R69 305 aa20.69■□□□□ 0.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 J3QT63 122 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 WNT10AQ9GZT5 417 aa20.68■□□□□ 0.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 ARG1P05089 322 aa20.67■□□□□ 0.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF684Q5T5D7 378 aa20.66■□□□□ 0.9
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CAPNS1-211ENST00000590874 RPS4Y2Q8TD47 263 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ITFG2Q969R8 447 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TTTY10Q9BZA0 68 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 YIPF3Q9GZM5 350 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS22Q9GZN4 317 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HES4Q9HCC6 221 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 OR14J1Q9UGF5 321 aa20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 HMGN1P05114 100 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 APOFQ13790 326 aa20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
CAPNS1-211ENST00000590874 GK3PQ14409 553 aa20.65■□□□□ 0.9
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