RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589727.5

ATP6V0A1-222, Transcript of ATPase H+ transporting V0 subunit a1, human

TSL 5

Gene ATP6V0A1, Length 664 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SHBG	P04278	402 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NR2C1	P13056	603 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GABRA2	P47869	451 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CRISP3	P54108	245 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RUNX1	Q01196	453 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CASP8	Q14790	479 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ULK3	Q6PHR2	472 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLC25A47	Q6Q0C1	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WDR82	Q6UXN9	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANKRD46	Q86W74	232 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DGCR8	Q8WYQ5	773 aa	Known RBP eCLIP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PANX1	Q96RD7	426 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	YY1AP1	Q9H869	796 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	GNB4	Q9HAV0	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VSIG4	Q9Y279	399 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LRP2	P98164	4655 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR6C6	A6NF89	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CD300LB	A8K4G0	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TIPRL	O75663	272 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TPPP	O94811	219 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HIST1H2AB	P04908	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	BPGM	P07738	259 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF823	P16415	610 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MAL	P21145	153 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HTR1D	P28221	377 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	S100A3	P33764	101 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZSCAN26	Q16670	478 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SPANXN4	Q5MJ08	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PGAP1	Q75T13	922 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HIST3H2A	Q7L7L0	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DPY19L4	Q7Z388	723 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DPP10	Q8N608	796 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HIST1H2AC	Q93077	130 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SLCO4A1	Q96BD0	722 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR51J1	Q9H342	316 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ADA2	Q9NZK5	511 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	STX18	Q9P2W9	335 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LGALS13	Q9UHV8	139 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C17orf98	A8MV24	154 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGLL5	B9A064	214 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LINC01619	G3V211	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TRIAP1	O43715	76 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FMO6P	O60774	539 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PTP4A3	O75365	173 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CH25H	O95992	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IGHG4	P01861	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM106CP	P0CH98	169 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LBP	P18428	481 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HTR2A	P28223	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CSNK2B	P67870	215 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZNF273	Q14593	569 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TIGD6	Q17RP2	521 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ARMC4	Q5T2S8	1044 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	LCN8	Q6JVE9	175 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	CALHM1	Q8IU99	346 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	DEFB125	Q8N687	156 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RBP7	Q96R05	134 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	ZBTB18	Q99592	522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	TMEM43	Q9BTV4	400 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	PARD6B	Q9BYG5	372 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	WDR13	Q9H1Z4	485 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	POLE4	Q9NR33	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FBXL17	Q9UF56	701 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	HHLA2	Q9UM44	414 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	IFT52	Q9Y366	437 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	FBXO7	Q9Y3I1	522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATP6V0A1-222	ENST00000589727	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		5.06	□□□□□ -1.6

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