RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 MELTFP08582 738 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 VSIG8P0DPA2 414 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 CCL2P13500 99 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 CCNOP22674 350 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 IL32P24001 234 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 CDK2P24941 298 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 RAD52P43351 418 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 RBP2P50120 134 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 EFNB2P52799 333 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 TAS2R20P59543 309 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 ZP1P60852 638 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 TRIM16LQ309B1 348 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 TMEM69Q5SWH9 247 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 TRIQKQ629K1 86 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 PRSS57Q6UWY2 283 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 GDPD3Q7L5L3 318 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 ZNF101Q8IZC7 436 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 POC5Q8NA72 575 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 C19orf18Q8NEA5 215 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 PXT1Q8NFP0 134 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 OR5A2Q8NGI9 324 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 RFT1Q96AA3 541 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 OCEL1Q9H607 264 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 IL36GQ9NZH8 169 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 RAB27BO00194 218 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 SELEP16581 610 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 ATP1B3P54709 279 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 MTCP1P56278 107 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 PPP1CBP62140 327 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 PLA2G7Q13093 441 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 UNC119Q13432 240 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 DYRK1AQ13627 763 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 GPR176Q14439 515 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 CEACAM21Q3KPI0 293 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 SAXO1Q8IYX7 474 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 DUSP18Q8NEJ0 188 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 PHF21AQ96BD5 680 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 TM2D1Q9BX74 207 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 BCL2L14Q9BZR8 327 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 SCPEP1Q9HB40 452 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 GPR173Q9NS66 373 aa10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
GGA3-217ENST00000583667 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 A0A1B0GWJ7 208 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 PQLC2LA1A4F0 135 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 AKR7A2O43488 359 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 ECDO95905 644 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 CELA3BP08861 270 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 CECR9P0C854 216 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 PPP3CBP16298 524 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 OR3A4PP47883 348 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 TSC22D1Q15714 1073 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 AWAT2Q6E213 333 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 RNF144BQ7Z419 303 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 OR56B2PQ8NGI1 322 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 FCAMRQ8WWV6 532 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 FAM46BQ96A09 425 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 S100PBPQ96BU1 408 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 MUCL1Q96DR8 90 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 BORCS8Q96FH0 119 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 GPER1Q99527 375 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 SLC22A4Q9H015 551 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 CST11Q9H112 138 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 LPAR5Q9H1C0 372 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 ATG5Q9H1Y0 275 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 POFUT1Q9H488 388 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 PTTG3PQ9NZH4 202 aa10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 OR5B21A6NL26 309 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 IQCF6A8MYZ5 107 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 C16orf97H3BN30 126 aa10.19□□□□□ -0.78
GGA3-217ENST00000583667 H7C417 338 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms