RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568494.1

ZNRF1-208, Transcript of zinc and ring finger 1, human

TSL 2

Gene ZNRF1, Length 2,046 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNRF1-208	ENST00000568494	ARFRP1	Q13795	201 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR8B8	Q15620	311 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	TOR2A	Q5JU69	321 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	PIGC	Q92535	297 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR2A7	Q96R45	310 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OCSTAMP	Q9BR26	566 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATPIF1	Q9UII2	106 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	FREM1	Q5H8C1	2179 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	C5orf49	A4QMS7	147 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	GOSR2	O14653	212 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	SNAPC5	O75971	98 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	AGTR1	P30556	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RAP2B	P61225	183 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RAB1A	P62820	205 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	MICB	Q29980	383 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	FBXW5	Q969U6	566 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RRP8	O43159	456 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	COX5B	P10606	129 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	TBP	P20226	339 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	GABRR1	P24046	479 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ARR3	P36575	388 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RBP2	P50120	134 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RAB14	P61106	215 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OPCML	Q14982	345 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	GRK1	Q15835	563 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	SIGIRR	Q6IA17	410 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ST8SIA4	Q92187	359 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494		Q96M66	194 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ST6GALNAC5	Q9BVH7	336 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	PLSCR5	A0PG75	271 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR2AT4	A6NND4	320 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CFD	P00746	253 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	IFNA6	P05013	189 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CPT2	P23786	658 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	FUT6	P51993	359 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	H2BFS	P57053	126 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZMYND11	Q15326	602 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RSU1	Q15404	277 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	HIKESHI	Q53FT3	197 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ASCL4	Q6XD76	172 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	RFPL4B	Q6ZWI9	263 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	COMMD7	Q86VX2	200 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	OR1K1	Q8NGR3	316 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	SUN5	Q8TC36	379 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	TMPRSS13	Q9BYE2	586 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF175	Q9Y473	711 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494		H3BUI4	141 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	IL18BP	O95998	194 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGKV1D-12	P01611	117 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	IGHG3	P01860	377 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	PDGFA	P04085	211 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	MPG	P29372	298 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CBX5	P45973	191 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ATP1B3	P54709	279 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	HOGA1	Q86XE5	327 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	REPIN1	Q9BWE0	567 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	STARD10	Q9Y365	291 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	BSN	Q9UPA5	3926 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	TUBAL3	A6NHL2	446 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	ZNF35	P13682	527 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	CXCL2	P19875	107 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	AMY2B	P19961	511 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	GK2	Q14410	553 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	HLX	Q14774	488 aa	Predicted RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ZNRF1-208	ENST00000568494	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.47	□□□□□ -0.57

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms