RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559		G3V3Y1	287 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SYNGR3	O43761	229 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GDF9	O60383	454 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SFTPB	P07988	381 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SRD5A2	P31213	254 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SMCO1	Q147U7	214 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DTX1	Q86Y01	620 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR51F2	Q8NH61	342 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR1F12	Q8NHA8	337 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CARHSP1	Q9Y2V2	147 aa	Known RBP	16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FAM74A7	A6NL05	159 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC5	O15389	551 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ACTL6A	O96019	429 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGHE	P01854	428 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FOLR3	P41439	243 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RBP2	P50120	134 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ARHGDIB	P52566	201 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PJVK	Q0ZLH3	352 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PADI1	Q9ULC6	663 aa		16.06	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CNTRL	Q7Z7A1	2325 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CFI	P05156	583 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR5H8	P0DN80	308 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ACKR3	P25106	362 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SMIM8	Q96KF7	97 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RGCC	Q9H4X1	137 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	KCNIP3	Q9Y2W7	256 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		16.05	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559		F8W036	122 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CARD18	P57730	90 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	BLOC1S1	P78537	153 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZFP36L1	Q07352	338 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ASCL4	Q6XD76	172 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CRLF2	Q9HC73	371 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559		K7EPK0	472 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CST4	P01036	141 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	LCAT	P04180	440 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559		P04436	131 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	HKR1	P10072	659 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CHAF1B	Q13112	559 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PUSL1	Q8N0Z8	303 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	BORCS8	Q96FH0	119 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SEC11C	Q9BY50	192 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SDK2	Q58EX2	2172 aa		16.04	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR6C6	A6NF89	314 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GPR31	O00270	319 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	JTB	O76095	146 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	CCL4	P13236	92 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ICAM2	P13598	275 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF708	P17019	499 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	IL32	P24001	234 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1C2	P52895	323 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	PCBD1	P61457	104 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	AKR1C1	Q04828	323 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF774	Q6NX45	483 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM200A	Q86VY9	491 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF100	Q8IYN0	542 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	MICU1	Q9BPX6	476 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TREM1	Q9NP99	234 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	NDRG3	Q9UGV2	375 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	DEDD	O75618	318 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	SNAPIN	O95295	136 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	RPL12	P30050	165 aa	Known RBP	16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TAF9	Q16594	264 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM42	Q69YG0	159 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	TECTB	Q96PL2	329 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		16.03	■□□□□ 0.16
RRN3-205	ENST00000563559	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		16.03	■□□□□ 0.16

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