RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552688.5

CS-233, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-233	ENST00000552688	POU4F2	Q12837	409 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	IL18R1	Q13478	541 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	DOC2B	Q14184	412 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	HERPUD1	Q15011	391 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	FAM189A2	Q15884	450 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	WDR38	Q5JTN6	314 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SAMD5	Q5TGI4	173 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	XAF1	Q6GPH4	301 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688		Q6ZPA2	131 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	CMTM4	Q8IZR5	234 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RDH10	Q8IZV5	341 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	BATF2	Q8N1L9	274 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR2T27	Q8NH04	317 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ASB17	Q8WXJ9	295 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RORB	Q92753	470 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GGH	Q92820	318 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR10A2	Q9H208	303 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	NIPAL2	Q9H841	368 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GPR84	Q9NQS5	396 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	EXOSC5	Q9NQT4	235 aa	Known RBP eCLIP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	UFSP2	Q9NUQ7	469 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ERVK13-1	Q9NX77	482 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RPL36	Q9Y3U8	105 aa	Known RBP	5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688		R4GMQ9	66 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	hCG_38984	A0A1B0GV85	526 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	CD300LB	A8K4G0	201 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688		G3V4G9	280 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688		J3QRE1	110 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	DVL1	O14640	695 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	XRCC2	O43543	280 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PAH	P00439	452 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	TTR	P02766	147 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LIMS3	P0CW19	117 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LIMS4	P0CW20	117 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	FAH	P16930	419 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	MYF6	P23409	242 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ACKR3	P25106	362 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GABRA5	P31644	462 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GSK3A	P49840	483 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GMFB	P60983	142 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ACTC1	P68032	377 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ACTA1	P68133	377 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	FAM3A	P98173	230 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ROM1	Q03395	351 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ST3GAL4	Q11206	333 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RAB40B	Q12829	278 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	TMED1	Q13445	227 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR8G1	Q15617	311 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	MPPED2	Q15777	294 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	CEP78	Q5JTW2	689 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	STX19	Q8N4C7	294 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	MRAP	Q8TCY5	172 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PIGC	Q92535	297 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	TMEM80	Q96HE8	168 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PAPOLG	Q9BWT3	736 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	SMURF1	Q9HCE7	757 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		5.63	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	ZNF254	O75437	659 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	INMT	O95050	263 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LALBA	P00709	142 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	LHB	P01229	141 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	IGHA1	P01876	353 aa		5.62	□□□□□ -1.51
CS-233	ENST00000552688	GRP	P07492	148 aa		5.62	□□□□□ -1.51

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