RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CYSLTR2Q9NS75 346 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TREM2Q9NZC2 230 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LAMP3Q9UQV4 416 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CACNG2Q9Y698 323 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MED13LQ71F56 2210 aa6.89□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LRP5LA4QPB2 252 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 VSTM5A8MXK1 200 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 J3QT63 122 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CDIPTO14735 213 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LDLRAD4O15165 306 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MAGEB3O15480 346 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NDUFS7O75251 213 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LY6HO94772 140 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HPXP02790 462 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CALCBP10092 127 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 EGR1P18146 543 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MPZP25189 248 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HTR2CP28335 458 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PTGFRP43088 359 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NPBWR2P48146 333 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PPOXP50336 477 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 RORCP51449 518 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ATP1B3P54709 279 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 QRFPP83859 136 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 UNC119Q13432 240 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 AGAP6Q5VW22 663 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 AWAT2Q6E213 333 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 WDR82Q6UXN9 313 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CDH26Q8IXH8 852 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TMEM104Q8NE00 496 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 OR51D1Q8NGF3 324 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SLAMF9Q96A28 289 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MARVELD3Q96A59 401 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SEH1LQ96EE3 360 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C14orf79Q96F83 325 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MIXL1Q9H2W2 232 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LIN7BQ9HAP6 207 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ABCB9Q9NP78 766 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 STEAP1Q9UHE8 339 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 USF3Q68DE3 2245 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 DSCAMO60469 2012 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 A6NLC8 198 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TMEM210A6NLX4 147 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 OVOL3O00110 214 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 CTDSP2O14595 271 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 WNT9BO14905 357 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SFTPBP07988 381 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TMEM225BP0DP42 221 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LYNX1P0DP58 116 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 VSIG8P0DPA2 414 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 BCL3P20749 454 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 GATA4P43694 442 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 GMFBP60983 142 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 IL24Q13007 206 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 RIN1Q13671 783 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MOGQ16653 247 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FAM209AQ5JX71 171 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FAM201AQ5SY85 155 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ASCL4Q6XD76 172 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 ZNF573Q86YE8 665 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 LAX1Q8IWV1 398 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SPERTQ8NA61 448 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 OR51F2Q8NH61 342 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 MCFD2Q8NI22 146 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 YIPF5Q969M3 257 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FAM46BQ96A09 425 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 PKIBQ9C010 78 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 BANF2Q9H503 90 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 NEK6Q9HC98 313 aa6.87□□□□□ -1.31
CS-216ENST00000549221 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms