RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520687.1

SPARC-202, Transcript of secreted protein acidic and cysteine rich, humanhuman

TSL 2

Gene SPARC, Length 1,598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARC-202ENST00000520687 SOX7Q9BT81 388 aa8.66□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SHPKQ9UHJ6 478 aa8.66□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 OPN4Q9UHM6 478 aa8.66□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.66□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 A0A0A6YYD4 124 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 FAM166BA8MTA8 275 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 E9PLN8 166 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 J3QW42 95 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 M0R233 179 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SOCS1O15524 211 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 TMEM225BP0DP42 221 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 LIPCP11150 499 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 TMEM50BP56557 158 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 ARG2P78540 354 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 PLP2Q04941 152 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 MALLQ13021 153 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 RSU1Q15404 277 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 GRK1Q15835 563 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 ZNF766Q5HY98 468 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 TOR2AQ5JU69 321 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 CLLU1Q5K131 121 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 LYG2Q86SG7 212 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 CCDC36Q8IYA8 594 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 FTMTQ8N4E7 242 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 ZNF680Q8NEM1 530 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 OR5H2Q8NGV7 314 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 AKR7LQ8NHP1 331 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 ST8SIA4Q92187 359 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 CMBLQ96DG6 245 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 BORCS8Q96FH0 119 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 PHB2Q99623 299 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SLC6A15Q9H2J7 730 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 SLC7A10Q9NS82 523 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 PLA2G3Q9NZ20 509 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 KCNN3Q9UGI6 736 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 NUP50Q9UKX7 468 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 CACNA1CQ13936 2221 aa8.65□□□□□ -1.02
SPARC-202ENST00000520687 MGAQ8IWI9 3026 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 AMY2BP19961 511 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 DTYMKP23919 212 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 ZBTB25P24278 435 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 CD34P28906 385 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 HRH1P35367 487 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 OR3A2P47893 321 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 ZNF81P51508 661 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 FAM3AP98173 230 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 SRYQ05066 204 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 RTP5Q14D33 572 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 TMEM65Q6PI78 240 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 C11orf88Q6PI97 169 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 TUSC5Q8IXB3 177 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 MITD1Q8WV92 249 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 Q96M66 194 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 SPACA5Q96QH8 159 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 NICN1Q9BSH3 213 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 PECRQ9BY49 303 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 CHIAQ9BZP6 476 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 BANF2Q9H503 90 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 LDAHQ9H6V9 325 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 LRRK2Q5S007 2527 aa8.65□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.64□□□□□ -1.03
SPARC-202ENST00000520687 C5orf63A6NC05 138 aa8.64□□□□□ -1.03
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