RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503362.1

SPCS3-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS3, Length 4,571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3-201ENST00000503362 ENY2Q9NPA8 101 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 OBP2BQ9NPH6 170 aa11.72□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF32P17041 273 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 GSK3AP49840 483 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 ARG2P78540 354 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 MIDNQ504T8 468 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 FGF11Q92914 225 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 FSCN3Q9NQT6 498 aa11.71□□□□□ -0.53
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SPCS3-201ENST00000503362 HBE1P02100 147 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 TSPO2Q5TGU0 170 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 LFNGQ8NES3 379 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 OR2I1PQ8NGU4 316 aa11.71□□□□□ -0.53
SPCS3-201ENST00000503362 NMES1Q9C002 83 aa11.71□□□□□ -0.53
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SPCS3-201ENST00000503362 TUSC2O75896 110 aa11.71□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 PNLIPP16233 465 aa11.71□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OR5AS1Q8N127 324 aa11.71□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa11.71□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 APH1AQ96BI3 265 aa11.71□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 UQCC1Q9NVA1 299 aa11.71□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OR6C6A6NF89 314 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 CST7O76096 145 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM33P57088 247 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ZNF345Q14585 488 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 MARVELD3Q96A59 401 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 UCN2Q96RP3 112 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 GFI1Q99684 422 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.7□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 OR5AC1P0C628 307 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 SLC25A4P12235 298 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ZBTB25P24278 435 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OR10J5Q8NHC4 309 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 SUCNR1Q9BXA5 334 aa11.7□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 DNAJB11Q9UBS4 358 aa11.7□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 ZNF273Q14593 569 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 WDR1O75083 606 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OR2C1O95371 312 aa11.69□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 AADACP22760 399 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 NDUFA6P56556 154 aa11.69□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 HBG2P69892 147 aa11.69□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.69□□□□□ -0.54
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SPCS3-201ENST00000503362 YKT6O15498 198 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 ISG15P05161 165 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 TMEM123Q8N131 208 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 NPTNQ9Y639 398 aa11.69□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 COL4A6Q14031 1691 aa11.68□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa11.68□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 RAB5CP51148 216 aa11.68□□□□□ -0.54
SPCS3-201ENST00000503362 LSM6P62312 80 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
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