RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498417.5

ANKRD54-210, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD54, Length 2,403 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-210ENST00000498417 CHAF1BQ13112 559 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TAF9Q16594 264 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TMED6Q8WW62 240 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 LIME1Q9H400 295 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ACKR4Q9NPB9 350 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 GSKIPQ9P0R6 139 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 NCKAP5O14513 1909 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 LRRC3CA6NJW4 275 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RRP8O43159 456 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 LCATP04180 440 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CD79AP11912 226 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OTX2P32243 289 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RRADP55042 308 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 DEFA5Q01523 94 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TRIM61Q5EBN2 209 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SPSB1Q96BD6 273 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 METTL9Q9H1A3 318 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 C12orf4Q9NQ89 552 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 DEPPQ9NTK1 212 aa13.55□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OR6C6A6NF89 314 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM157CP0CG43 387 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 PSG4Q00888 419 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RTL6Q6ICC9 239 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 AAED1Q7RTV5 226 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CPT1CQ8TCG5 803 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 KCNE4Q8WWG9 221 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ADGRG7Q96K78 797 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 AQP10Q96PS8 301 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RAB19A4D1S5 217 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CSTBP04080 98 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RGS19P49795 217 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 AKR1C2P52895 323 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 AKR1C1Q04828 323 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RSU1Q15404 277 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 PLXDC2Q6UX71 529 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OR10D3Q8NH80 312 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 AK3Q9UIJ7 227 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ANXA10Q9UJ72 324 aa13.54□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF205O95201 554 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 IFNA2P01563 188 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 IGKV1D-12P01611 117 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 STK11Q15831 433 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF585AQ6P3V2 769 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC5A7Q9GZV3 580 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 DECR2Q9NUI1 292 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TCFL5Q9UL49 500 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM74A7A6NL05 159 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CER1O95813 267 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ACTL6AO96019 429 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SFTPBP07988 381 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OPRM1P35372 400 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SPEM2Q0P670 501 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SCRN3Q0VDG4 424 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CEACAM16Q2WEN9 425 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM42Q69YG0 159 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 BRICD5Q6PL45 260 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 UQCC3Q6UW78 93 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ASCL4Q6XD76 172 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CCDC36Q8IYA8 594 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 DYRK2Q92630 601 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 FOXB1Q99853 325 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.53□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TMEM218A2RU14 115 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 PINLYPA6NC86 204 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TERTO14746 1132 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TRAPPC6AO75865 159 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OR5H8P0DN80 308 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 HTR5AP47898 357 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 S100A10P60903 97 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OR2V1Q8NHB1 315 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 RNF141Q8WVD5 230 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 OR2H1Q9GZK4 316 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SLC6A15Q9H2J7 730 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 SMOC1Q9H4F8 434 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 HSF4Q9ULV5 492 aa13.52□□□□□ -0.24
ANKRD54-210ENST00000498417 F10P00742 488 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD54-210ENST00000498417 NRASP01111 189 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD54-210ENST00000498417 ZNF708P17019 499 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD54-210ENST00000498417 CHATP28329 748 aa13.52□□□□□ -0.25
ANKRD54-210ENST00000498417 RBMXP38159 391 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
ANKRD54-210ENST00000498417 RBP2P50120 134 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms