RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PATE4P0C8F1 98 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PPT1P50897 306 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MLF1P58340 268 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ACTBP60709 375 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ACTG1P63261 375 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 Q0VFX4 171 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PPA1Q15181 289 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DNM1P46Q6ZS02 220 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FJX1Q86VR8 437 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 BPIFB2Q8N4F0 458 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SLC22A24Q8N4F4 322 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM104Q8NE00 496 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.13□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 WNT2BQ93097 391 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 C1orf159Q96HA4 380 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PGAM5Q96HS1 289 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MICU1Q9BPX6 476 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 USP24Q9UPU5 2620 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ARPC5O15511 151 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 KLK10O43240 276 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 P04436 131 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF35P13682 527 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GABRA1P14867 456 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ADH6P28332 368 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR3A4PP47883 348 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TAS2R19P59542 299 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TFF3Q07654 80 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR10K1Q8NGX5 313 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SLAMF9Q96A28 289 aa6.13□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 PIGQQ9BRB3 760 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 POFUT1Q9H488 388 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SLC17A5Q9NRA2 495 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PLEK2Q9NYT0 353 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TREM2Q9NZC2 230 aa6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CXorf65A6NEN9 183 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LDLRAD4O15165 306 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NQO2P16083 231 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SPINK2P20155 84 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 H2BFSP57053 126 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 BLOC1S1P78537 153 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SORDQ00796 357 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 LIN54Q6MZP7 749 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF383Q8NA42 475 aa6.12□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 OR9K2Q8NGE7 335 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 C14orf144Q96I85 54 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ULBP2Q9BZM5 246 aa6.12□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAB22AQ9UL26 194 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNHIT1O43257 154 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CXCL13O43927 109 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 IGHV3-9P01782 118 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 FAHP16930 419 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZNF17P17021 662 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 MSR1P21757 451 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 RAB4BP61018 213 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 H3F3AP84243 136 aa6.12□□□□□ -1.43
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HERC4-211ENST00000492996 OR5AS1Q8N127 324 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PSMF1Q92530 271 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PRO1933Q9H354 126 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 ZFP57Q9NU63 452 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 TMEM160Q9NX00 188 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 SOCS1O15524 211 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 DHHO43323 396 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CBR3O75828 277 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 PMS2P2O95744 297 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 IL5P05113 134 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CFPP27918 469 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 NTF4P34130 210 aa6.12□□□□□ -1.43
HERC4-211ENST00000492996 CA7P43166 264 aa6.12□□□□□ -1.43
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