RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488550.5

MEIS1-209, Transcript of Meis homeobox 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MEIS1, Length 5,111 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS1-209ENST00000488550 OR2V2Q96R30 315 aa6.78□□□□□ -1.32
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MEIS1-209ENST00000488550 EID2BQ96D98 161 aa6.76□□□□□ -1.33
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MEIS1-209ENST00000488550 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.76□□□□□ -1.33
MEIS1-209ENST00000488550 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.76□□□□□ -1.33
MEIS1-209ENST00000488550 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.76□□□□□ -1.33
MEIS1-209ENST00000488550 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
MEIS1-209ENST00000488550 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa6.76□□□□□ -1.33
MEIS1-209ENST00000488550 HLA-DQA1P01909 254 aa6.76□□□□□ -1.33
MEIS1-209ENST00000488550 IQCF3P0C7M6 154 aa6.76□□□□□ -1.33
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