RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 FGGYQ96C11 551 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 BORCS8Q96FH0 119 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SUCNR1Q9BXA5 334 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CHST5Q9GZS9 411 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 COMMD4Q9H0A8 199 aa16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR37O15354 613 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNGR1O43759 233 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FSHBP01225 129 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC159P0C7I6 412 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OCM2P0CE71 109 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FGF12P61328 243 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 IL13RA1P78552 427 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SMIM21Q3B7S5 101 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF788Q6ZQV5 615 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ANGPTL5Q86XS5 388 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ANGPTL6Q8NI99 470 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 JMJD8Q96S16 334 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PKIBQ9C010 78 aa15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 A0A1B0GW55 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OR4C45A6NMZ5 311 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NXPH2O95156 264 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L2P0CJ85 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L3P0CJ86 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L4P0CJ87 422 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L5P0CJ88 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L6P0CJ89 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L7P0CJ90 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PSG2P11465 335 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MYL12AP19105 171 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 AMY2BP19961 511 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ATP1B3P54709 279 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL11BQ5VVY1 283 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ACP7Q6ZNF0 438 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OR5AK2Q8NH90 309 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 C22orf15Q8WYQ4 148 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 UPRTQ96BW1 309 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF488Q96MN9 340 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF649Q9BS31 505 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PCGF1Q9BSM1 259 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 JAM3Q9BX67 310 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CNTD2Q9H8S5 307 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DUX4Q9UBX2 424 aa15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM212A6NML5 194 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF879B4DU55 563 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SIGLEC5O15389 551 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TOX4O94842 621 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 LIMS3P0CW19 117 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 LIMS4P0CW20 117 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PGA5P0DJD9 388 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NDUFB7P17568 137 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ATF1P18846 271 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 PRKACBP22694 351 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 IL24Q13007 206 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 USP43Q70EL4 1123 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CALHM1Q8IU99 346 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TMEM80Q96HE8 168 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 GAFA1Q96PS6 74 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A7Q99884 636 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 NEK6Q9HC98 313 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF69Q9UC07 566 aa15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RFPL4AA6NLU0 287 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 E9PI62 339 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 H0YHG0 523 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CYB5AP00167 134 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 TFF1P04155 84 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 MPZP25189 248 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 RBP2P50120 134 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ETV1P50549 477 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 CAPZA1P52907 286 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 ARF6P62330 175 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR157Q5UAW9 335 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 UTS2BQ765I0 119 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 FGFRL1Q8N441 504 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DNAAF1Q8NEP3 725 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 OR10AC1Q8NH08 325 aa15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SH3BP4-209ENST00000484097 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa15.95■□□□□ 0.14
SH3BP4-209ENST00000484097 TRAV40A0A0B4J280 105 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms