RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481848.6

SOGA3-207, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

APPRIS P5 TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 11,464 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-207ENST00000481848 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF716A6NP11 495 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PITX3O75364 302 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF766Q5HY98 468 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 PTOV1Q86YD1 416 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OCIAD1Q9NX40 245 aa11.28□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 COCHO43405 550 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 NID1P14543 1247 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SLC19A1P41440 591 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 RNF165Q6ZSG1 346 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 HSD17B8Q92506 261 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MSL2Q9HCI7 577 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CBLN4Q9NTU7 201 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 NPIPB9F8W1W9 429 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CCR5P51681 352 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MORN1Q5T089 497 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 KREMEN2Q8NCW0 462 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR10G4Q8NGN3 311 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 GTF3C1Q12789 2109 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 IGHA1P01876 353 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 IGHA2P01877 340 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 F13BP05160 661 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 CKS1BP61024 79 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.27□□□□□ -0.6
SOGA3-207ENST00000481848 SYPL1Q16563 259 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF506Q5JVG8 444 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 M0R296 226 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TBX18O95935 607 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CLDN15P56746 228 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 BTG2P78543 158 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 DLEU7Q6UYE1 221 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 GLCCI1Q86VQ1 547 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SPPL3Q8TCT6 385 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM56Q96MV1 263 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PPP1R1AQ13522 171 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 HFEQ30201 348 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 METTL27Q8N6F8 245 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RARRES3Q9UL19 164 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RABIFP47224 123 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ABHD17BQ5VST6 288 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 KLK6Q92876 244 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TRDCB7Z8K6 153 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZNF217O75362 1048 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 C1orf105O95561 183 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 IER3P46695 156 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ROM1Q03395 351 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 XKR7Q5GH72 579 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 C16orf82Q7Z2V1 217 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 WNT11O96014 354 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CAMPP49913 170 aa11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RPL27P61353 136 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SNURFLB1AK76 121 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 LTC4SQ16873 150 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MRC1P22897 1456 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 PMP22Q01453 160 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SLC25A17O43808 307 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CST7O76096 145 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CRYBB2P43320 205 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 P2RX4Q99571 388 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RARRES2Q99969 163 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 CES1P1Q9UKY3 287 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 NOTCH3Q9UM47 2321 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 DACT2Q5SW24 774 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TMEM255BQ8WV15 326 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SOD3P08294 240 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SRYQ05066 204 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 MUCL1Q96DR8 90 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ZBP1Q9H171 429 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TINAGQ9UJW2 476 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 A0A1B0GWA3 101 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 C17orf67Q0P5P2 114 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 TCF23Q7RTU1 214 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 SLC7A10Q9NS82 523 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 OR51B4Q9Y5P0 310 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ICAM2P13598 275 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 RPS23P62266 143 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 ADOQ96SZ5 270 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
SOGA3-207ENST00000481848 NPWQ8N729 165 aa11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.8 ms