RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476635.5

PRKCI-202, Transcript of protein kinase C iota, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKCI, Length 3,650 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCI-202ENST00000476635 SNRPGP15A8MWD9 76 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 NAPSAO96009 420 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 NGFP01138 241 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 LHBP01229 141 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CELA3BP08861 270 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 AKAIN1P0CW23 69 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MGMTP16455 207 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 HLA-GP17693 338 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RPS23P62266 143 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MTFR2Q6P444 385 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GFRALQ6UXV0 394 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 LUZP2Q86TE4 346 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 UBE2J2Q8N2K1 259 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM104Q8NE00 496 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 PTTG3PQ9NZH4 202 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SMIM30A4D0T7 59 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CD79AP11912 226 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MDH2P40926 338 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CLDN12P56749 244 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 LY6G6FQ5SQ64 297 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 Q6P435 159 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ZNF554Q86TJ5 538 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 TCTE3Q8IZS6 198 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 TOMM5Q8N4H5 51 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ARRDC1Q8N5I2 433 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 OR56B4Q8NH76 319 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 S100PBPQ96BU1 408 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RADILQ96JH8 1075 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 NRIP2Q9BQI9 281 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RTL8AQ9BWD3 113 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 DPAGT1Q9H3H5 408 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CDH20Q9HBT6 801 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MCUBQ9NWR8 336 aa5.5□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RAD51DO75771 328 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CYB5AP00167 134 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 IGHV3-9P01782 118 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 IGFBP2P18065 325 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 PTAFRP25105 342 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 KCNJ3P48549 501 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 PSG7Q13046 419 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 OSR2Q8N2R0 312 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SPICQ8N5J4 248 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GALNT11Q8NCW6 608 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM171Q8WVE6 324 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MRGPRFQ96AM1 343 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 BORCS8Q96FH0 119 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GPR173Q9NS66 373 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SLC23A1Q9UHI7 598 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GPR160Q9UJ42 338 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 A0A0B4J2A0 478 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 IFNL4K9M1U5 179 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RBBP9O75884 186 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 LYZL6O75951 148 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CSN2P05814 226 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 FAM87AP0C7U9 286 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CHRNB4P30926 498 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ODF4Q2M2E3 257 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 NCMAPQ5T1S8 102 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 DHRS11Q6UWP2 260 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GCNT2Q8N0V5 402 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 OR8H2Q8N162 312 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 JAGN1Q8N5M9 183 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 LILRB4Q8NHJ6 448 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SNAPC3Q92966 411 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CABLES2Q9BTV7 478 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ATG5Q9H1Y0 275 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 MLNRO43193 412 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SSX4O60224 188 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 SNAPC5O75971 98 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 TCRBP04435 133 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 HCKP08631 526 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 GTF2F2P13984 249 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 UCP3P55916 312 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 ADORA2A-AS1P86434 159 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CD276Q5ZPR3 534 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 CALHM1Q8IU99 346 aa5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
PRKCI-202ENST00000476635 TMEM185AQ8NFB2 350 aa5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.1 ms