RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423		Q6YL49	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CBLL1	Q75N03	491 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR10A6	Q8NH74	314 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR56B4	Q8NH76	319 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OXGR1	Q96P68	337 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CPPED1	Q9BRF8	314 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CHIA	Q9BZP6	476 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GSN-AS1	Q9NRJ2	163 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TNFRSF19	Q9NS68	423 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DUSP13	Q9UII6	198 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF222	Q9UK12	451 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423		V9GYQ6	96 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00587	B1AMM8	73 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RFXANK	O14593	260 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IMPA2	O14732	288 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SGCE	O43556	437 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RAB36	O95755	333 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IFNG	P01579	166 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HSMCR30	P0CW71	290 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GABRA5	P31644	462 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CRISP3	P54108	245 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GMFB	P60983	142 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PITPNA	Q00169	270 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TPBG	Q13641	420 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF627	Q7L945	461 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	UEVLD	Q8IX04	471 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SSMEM1	Q8WWF3	244 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DDB2	Q92466	427 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RFT1	Q96AA3	541 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	FOXB1	Q99853	325 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TPT1P8	Q9HAU6	139 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC25A19	Q9HC21	320 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NDUFAF4	Q9P032	175 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	VAPA	Q9P0L0	249 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IL20RA	Q9UHF4	553 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DMRT1	Q9Y5R6	373 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A0B4J2E0	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1B0GX12	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PLSCR5	A0PG75	271 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	C17orf100	A8MU93	164 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	JTB	O76095	146 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	CDRT1	O95170	752 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PLAT	P00750	562 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	IGHV2-70	P01814	119 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	NFYA	P23511	347 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	LMO1	P25800	156 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	KDELR2	P33947	212 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	MPV17	P39210	176 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	PMEL	P40967	661 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	HMGA2	P52926	109 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	BID	P55957	195 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RAB5B	P61020	215 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	RAB1A	P62820	205 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DEFB112	Q30KQ8	113 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SZRD1-208	ENST00000476423	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36

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