RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474147.5

RBMS1-208, Transcript of RNA binding motif single stranded interacting protein 1, human

TSL 2

Gene RBMS1, Length 2,854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBMS1-208	ENST00000474147	TNFSF4	P23510	183 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	PSMB5	P28074	263 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CLDN6	P56747	220 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TBPL1	P62380	186 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	DUSP2	Q05923	314 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	HYAL1	Q12794	435 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ACOT6	Q3I5F7	207 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CST9LP1	Q5W188	147 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	LCN10	Q6JVE6	187 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CSNK1A1L	Q8N752	337 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	NECAP1	Q8NC96	275 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ELOA3	Q8NG57	546 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	DYRK2	Q92630	601 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	NMNAT3	Q96T66	252 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CALHM2	Q9HA72	323 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CLN8	Q9UBY8	286 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	VWA8	A3KMH1	1905 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	COL16A1	Q07092	1604 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	OR5B21	A6NL26	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	GPR137B	O60478	399 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TACSTD2	P09758	323 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	IGLC2	P0DOY2	106 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	IGLC3	P0DOY3	106 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	GLRA1	P23415	457 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	GCH1	P30793	250 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	LINC00310	P59036	64 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	RAB11A	P62491	216 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CDK3	Q00526	305 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	OR1Q1	Q15612	314 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CLEC12B	Q2HXU8	276 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147		Q8N976	141 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF519	Q8TB69	540 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	RSPRY1	Q96DX4	576 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	AHSP	Q9NZD4	102 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	WIPI2	Q9Y4P8	454 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	LRP12	Q9Y561	859 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	SERTM2	A0A1B0GWG4	89 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM212	A6NML5	194 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	C4orf47	A7E2U8	309 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147		E5RGE8	158 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147		K7ERU9	68 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CORT	O00230	105 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	MSTN	O14793	375 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	SEMA4F	O95754	770 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	DDAH2	O95865	285 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TYMS	P04818	313 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	NGFR	P08138	427 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	OR4Q2	P0C623	313 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	SLC6A6	P31641	620 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CCKBR	P32239	447 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	PSEN2	P49810	448 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ASCL1	P50553	236 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	RAB28	P51157	221 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	RAB38	P57729	211 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	PRR27	Q6MZM9	219 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM64	Q6YI46	380 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	TMEM184A	Q6ZMB5	413 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	CALHM1	Q8IU99	346 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RBMS1-208	ENST00000474147	ZNF709	Q8N972	641 aa		3.87	□□□□□ -1.79

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