RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470201.5

RABGGTB-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 848 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF649Q9BS31 505 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2S2Q9NQN1 319 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 C21orf62Q9NYP8 219 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 ANXA10Q9UJ72 324 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 GMEB1Q9Y692 573 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 ENPP4Q9Y6X5 453 aa2.8□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 ERICH2A1L162 156 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 F8VP50 259 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 PLPP3O14495 311 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV1D-16P01601 117 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 GIMD1P0DJR0 217 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 GRB2P62993 217 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 TRDNQ13061 729 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 PMVKQ15126 192 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 MAPRE2Q15555 327 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 LRRC8AQ8IWT6 810 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 BBS7Q8IWZ6 715 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 C17orf78Q8N4C9 275 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR5M1Q8NGP8 315 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR13G1Q8NGZ3 307 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR10C1Q96KK4 312 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2M4Q96R27 311 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 SPIN2AQ99865 258 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 C12orf4Q9NQ89 552 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 FBXO6Q9NRD1 293 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 PRO0628Q9UI54 55 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP2.79□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 C7orf66A4D0T2 115 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 SCO1O75880 301 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 MPZL1O95297 269 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 IGKV2D-28P01615 120 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 NQO2P16083 231 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 HLA-GP17693 338 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP12-2P59991 146 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 UBE2KP61086 200 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 PITPNAQ00169 270 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 DMC1Q14565 340 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 COX19Q49B96 90 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 UGT2A3Q6UWM9 527 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2M7Q8NG81 312 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2Z1Q8NG97 314 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 OR2Y1Q8NGV0 311 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 HGDQ93099 445 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 METTL26Q96S19 204 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 MAT2BQ9NZL9 334 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 DOCK8Q8NF50 2099 aa2.78□□□□□ -1.96
RABGGTB-207ENST00000470201 TMEM72A0PK05 275 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 ISPDA4D126 451 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF850A8MQ14 1090 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 IQCF5A8MTL0 148 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 UPK1AO00322 258 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 MAS1P04201 325 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4Q2P0C623 313 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 NELFEP18615 380 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 AZU1P20160 251 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 KRTAP5-9P26371 169 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 SLC18A1P54219 525 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 TAS2R43P59537 309 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 CEACAM16Q2WEN9 425 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 FAM222AQ5U5X8 452 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF880Q6PDB4 577 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 ZNF101Q8IZC7 436 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 ORMDL3Q8N138 153 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 OR8G5Q8NG78 346 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 OR4K2Q8NGD2 314 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 ANGPTL6Q8NI99 470 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 SPACA5Q96QH8 159 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 CYTH2Q99418 400 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 SPACA1Q9HBV2 294 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 TMBIM4Q9HC24 238 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 TAS2R5Q9NYW4 299 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 CD300AQ9UGN4 299 aa2.77□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 C2orf16Q68DN1 1984 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 AK9Q5TCS8 1911 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 MAP3K19Q56UN5 1328 aa2.76□□□□□ -1.97
RABGGTB-207ENST00000470201 A0A0G2JMP0 313 aa2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 309.7 ms