RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469529.6

TRAF4-208, Transcript of TNF receptor associated factor 4, human

TSL 2

Gene TRAF4, Length 788 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAF4-208	ENST00000469529	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		V9GYH0	126 aa		10.85	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MAST4	O15021	2626 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		A0A0B4J203	849 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529		B9A039	149 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CTDSPL	O15194	276 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MLNR	O43193	412 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	XRCC3	O43542	346 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	KDM4B	O94953	1096 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CD55	P08174	381 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TALDO1	P37837	337 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GATA4	P43694	442 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR3A4P	P47883	348 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	GPM6A	P51674	278 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	MAB21L1	Q13394	359 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	UNC119	Q13432	240 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR8G1	Q15617	311 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CNIH2	Q6PI25	160 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	CALHM1	Q8IU99	346 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	BHLHE23	Q8NDY6	225 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SPACA5	Q96QH8	159 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	S100A13	Q99584	98 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PLK3	Q9H4B4	646 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	PALMD	Q9NP74	551 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		10.84	□□□□□ -0.67
TRAF4-208	ENST00000469529	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PLSCR5	A0PG75	271 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A18P	A6NE21	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A16P	A6NEW6	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A22P	A8MWA6	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A12P	A8MX19	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A5P	A8MXJ8	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		H3BUI4	141 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		J3QT63	122 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	RAB27B	O00194	218 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CTAG2	O75638	210 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CYB5A	P00167	134 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A15P	P0C7V4	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A14P	P0C7W9	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	TMEM225B	P0DP42	221 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	GTF2F2	P13984	249 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HAAO	P46952	286 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PITPNB	P48739	271 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PITPNA	Q00169	270 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM209A	Q5JX71	171 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	WDR86	Q86TI4	376 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF611	Q8N823	705 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	NPRL2	Q8WTW4	380 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	AQP3	Q92482	292 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CCDC32	Q9BV29	185 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IL19	Q9UHD0	177 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ING4	Q9UNL4	249 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		10.83	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CAD	P27708	2225 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM25C	B3EWG5	89 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	FAM25G	B3EWG6	89 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529		H0YL77	283 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	C19orf84	I3L1E1	186 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	CDC14B	O60729	498 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	IGKV1D-12	P01611	117 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	HLA-DQB1	P01920	261 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MELTF	P08582	738 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	PMEL	P40967	661 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	EFNB2	P52799	333 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	ZNF154	Q13106	437 aa		10.82	□□□□□ -0.68
TRAF4-208	ENST00000469529	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68

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