RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 ATRAIDQ6UW56 229 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 NAA40Q86UY6 237 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 KCNRGQ8N5I3 272 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF283Q8N7M2 679 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF565Q8N9K5 539 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GPR119Q8TDV5 335 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 TAS2R4Q9NYW5 299 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 CBX5P45973 191 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.26□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SLC16A14Q7RTX9 510 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.26□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 MEF2DQ14814 521 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 RHEBQ15382 184 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FBXW9Q5XUX1 488 aa5.25□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 SYS1Q8N2H4 156 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.25□□□□□ -1.57
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SHQ1-205ENST00000468371 C11orf40Q8WZ69 217 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 THRSPQ92748 146 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 FGGYQ96C11 551 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 CMBLQ96DG6 245 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 GIMAP5Q96F15 307 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 DECR2Q9NUI1 292 aa5.25□□□□□ -1.57
SHQ1-205ENST00000468371 MAST4O15021 2626 aa5.25□□□□□ -1.57
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