RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 B2MP61769 119 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZP4Q12836 540 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 BRICD5Q6PL45 260 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR6K3Q8NGY3 331 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 WDR76Q9H967 626 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPH5 198 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 NPIPB13A6NJU9 1138 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 NPIPB4C9JG80 1138 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 E5RGE8 158 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 H3BSH0 61 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 IGHMP01871 453 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TMEM225BP0DP42 221 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PSMB10P40306 273 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 FABP5Q01469 135 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 AKR1C1Q04828 323 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 FOXF1Q12946 379 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KIRREL1Q96J84 757 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 GPR137Q96N19 417 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF75AQ96N20 296 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SPSB2Q99619 263 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 VAMP8Q9BV40 100 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 KCNS2Q9ULS6 477 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 AMDHD2Q9Y303 409 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 NSG2Q9Y328 171 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 UNC13CQ8NB66 2214 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 EML5Q05BV3 1969 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR6C68A6NDL8 312 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 MEIS3P1A6NDR6 274 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OGG1O15527 345 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 GLAP06280 429 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 HLA-DOBP13765 273 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 EFNA3P52797 238 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CD300CQ08708 224 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TGIF1Q15583 401 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR5M9Q8NGP3 310 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR2G3Q8NGZ4 309 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 NPRL2Q8WTW4 380 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TMEM106AQ96A25 262 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RASD2Q96D21 266 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 Q96M85 177 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ATF6BQ99941 703 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PPE2 198 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PR64 198 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 A0A1W2PRV1 198 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 NKX2-8O15522 239 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ADAM11O75078 769 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 NDUFB6O95139 128 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ABHD16AO95870 558 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RAC2P15153 192 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF85Q03923 595 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 VHLLQ6RSH7 139 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SHISA5Q8N114 240 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SMIM19Q96E16 107 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 LINC00052Q96N35 136 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 MUC6Q6W4X9 2439 aa6.8□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CLDN34H7C241 214 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 CYB5BO43169 146 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SCGB2A1O75556 95 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 OR4E1P0C645 316 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SFTA3P0C7M3 94 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 RD3LP0DJH9 198 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 ZNF250P15622 560 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 SLC6A1P30531 599 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 PTTG1IPP53801 180 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 FOXO1Q12778 655 aa6.79□□□□□ -1.32
USP54-210ENST00000466048 AARDQ4LEZ3 155 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms