RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF260Q3ZCT1 412 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 LINC01590Q5TEZ4 76 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF774Q6NX45 483 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 SPRED2Q7Z698 418 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HOGA1Q86XE5 327 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OR1L6Q8NGR2 347 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OR5R1Q8NH85 324 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 FAHD2AQ96GK7 314 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 COL4A5P29400 1685 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 NPIPA5E9PKD4 350 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 GCGP01275 180 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 IGHEP01854 428 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 IL12BP29460 328 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 RTP5Q14D33 572 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 Q6ZN92 141 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 Q7L0L9 218 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 C1QL4Q86Z23 238 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF321PQ8N8H1 164 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 EMC6Q9BV81 110 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF665Q9H7R5 613 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 NPIPA1Q9UND3 350 aa13.2□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 IL2RAP01589 272 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 FPR2P25090 351 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 MPZP25189 248 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 RRADP55042 308 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 C20orf196Q8IYI0 205 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 GPHA2Q96T91 129 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HEBP2Q9Y5Z4 205 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 GRIFINA4D1Z8 144 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 M0QZK8 103 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TBX19O60806 448 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 GGCTO75223 188 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF728P0DKX0 622 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TAS2R46P59540 309 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 Q6ZVH6 145 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 POC1AQ8NBT0 407 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 MFRPQ9BY79 579 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 A0A1B0GUS0 222 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 AQP7P3A6NL99 342 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 P2RY1P47900 373 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF595Q8IYB9 648 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OR13G1Q8NGZ3 307 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 PIGTQ969N2 578 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TECTBQ96PL2 329 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP13.19□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OR3A4PP47883 348 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 FMODQ06828 376 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 MGAT2Q10469 447 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 FOXQ1Q9C009 403 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OR10A2Q9H208 303 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 GDE1Q9NZC3 331 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 SPINK4O60575 86 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 GPR75O95800 540 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 PMELP40967 661 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 PRSS12P56730 875 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 EGR3Q06889 387 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ARHGAP19Q14CB8 494 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TCTN1Q2MV58 587 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 MORN1Q5T089 497 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 CBLN3Q6UW01 205 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 KCNG3Q8TAE7 436 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 MCHR2Q969V1 340 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 SLC46A2Q9BY10 475 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 OR2J1Q9GZK6 312 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 SHANK1Q9Y566 2161 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 A8MVM7 634 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ARPC3O15145 178 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HBE1P02100 147 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 NTF3P20783 257 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 HIST1H3AP68431 136 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 CHRDL2Q6WN34 429 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 CDC20BQ86Y33 519 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 RPS4Y2Q8TD47 263 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM230Q96A57 120 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF681Q96N22 645 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 WFDC1Q9HC57 220 aa13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP13.18□□□□□ -0.3
SOGA3-201ENST00000465909 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa13.18□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms