RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460297.1

NME4-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 5

Gene NME4, Length 1,652 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-209ENST00000460297 SWI5Q1ZZU3 235 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CMTM4Q8IZR5 234 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 AQP3Q92482 292 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FBXW5Q969U6 566 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CEP19Q96LK0 163 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CMTM3Q96MX0 182 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 S100A13Q99584 98 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 AKIP1Q9NQ31 210 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RHBDL2Q9NX52 303 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FBLN5Q9UBX5 448 aa20.56■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ART1P52961 327 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MPPED2Q15777 294 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CNIH2Q6PI25 160 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 C11orf53Q8IXP5 236 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 DIRAS2Q96HU8 199 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 PKIBQ9C010 78 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 METTL9Q9H1A3 318 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ABCG5Q9H222 651 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MTCH1Q9NZJ7 389 aa20.55■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FAM221AA4D161 298 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 C17orf100A8MU93 164 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FAM25AB3EWG3 89 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FAM25CB3EWG5 89 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FAM25GB3EWG6 89 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 J3QT63 122 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 HS3ST1O14792 307 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RHBDL1O75783 438 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 SERPINA2P20848 420 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 IL24Q13007 206 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 TMEM200AQ86VY9 491 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 SAXO1Q8IYX7 474 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 FBXL14Q8N1E6 418 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MFSD4AQ8N468 514 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 KCNG3Q8TAE7 436 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 SLAMF9Q96A28 289 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 PTX4Q96A99 478 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 OR2V2Q96R30 315 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 TLNRD1Q9H1K6 362 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 BANF2Q9H503 90 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CDIPTO14735 213 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 SFTPBP07988 381 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ADH4P08319 380 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ETV6P41212 452 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RANBP1P43487 201 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 NPBWR2P48146 333 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MZT1Q08AG7 82 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RSU1Q15404 277 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MKXQ8IYA7 352 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 DTX3Q8N9I9 347 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 OR4M1Q8NGD0 313 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MEGF10Q96KG7 1140 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 IL36GQ9NZH8 169 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RAB22AQ9UL26 194 aa20.54■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CDC14BO60729 498 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RAB6AP20340 208 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MADCAM1Q13477 382 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 BATF2Q8N1L9 274 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ITLN1Q8WWA0 313 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 GAL3ST1Q99999 423 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CST11Q9H112 138 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 UFSP2Q9NUQ7 469 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 EXTL2Q9UBQ6 330 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 V9GYH0 126 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa20.53■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 F8VVB4 439 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 F8VWA3 439 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 GOSR1O95249 250 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 MPIG6BO95866 241 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 BCL3P20749 454 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ZNF826PQ6ZT77 177 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 RAB40AQ8WXH6 277 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 ZNF488Q96MN9 340 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 DIRC2Q96SL1 478 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 DYNLRB1Q9NP97 96 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 IL19Q9UHD0 177 aa20.52■□□□□ 0.88
NME4-209ENST00000460297 CTAG2O75638 210 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 KDM4BO94953 1096 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 HTR3BO95264 441 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 MGMTP16455 207 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 SPANXN2Q5MJ10 180 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 A6NLC8 198 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 CLDN25C9JDP6 229 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 C3orf80F5H4A9 247 aa20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NME4-209ENST00000460297 CYB5AP00167 134 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms