RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 AWAT1Q58HT5 328 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 UQCC1Q9NVA1 299 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 GLB1P16278 677 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 COL9A1P20849 921 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 ZBTB25P24278 435 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 GPM6AP51674 278 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 GFERP55789 205 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 FFAR4Q5NUL3 377 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 ST8SIA1Q92185 356 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 BOD1Q96IK1 185 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
PTPRU-204ENST00000428026 ADAP1O75689 374 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 RFC3P40938 356 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 CNN1P51911 297 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 RTL8BQ17RB0 113 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SPATA46Q5T0L3 261 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FAM162BQ5T6X4 162 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 DUSP18Q8NEJ0 188 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 DPF1Q92782 380 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 EXTL1Q92935 676 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 S1PR3Q99500 378 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 NTMQ9P121 344 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 A0A087WUJ7 227 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SULT1A3P0DMM9 295 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SULT1A4P0DMN0 295 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SLC6A1P30531 599 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 BPIFB3P59826 476 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FAM209AQ5JX71 171 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF831Q5JPB2 1677 aa12.96□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 ABCD3P28288 659 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 RAG2P55895 527 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 ERHP84090 104 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 KIAA0040Q15053 153 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM183BQ1AE95 376 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 LIMS2Q7Z4I7 341 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 AMER3Q8N944 861 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 OR11H7Q8NGC8 314 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 OR2I1PQ8NGU4 316 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 KNTC1P50748 2209 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SELEP16581 610 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FAM3AP98173 230 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 CLN3Q13286 438 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MRGPREQ86SM8 312 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 VASH2Q86V25 355 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 OR6S1Q8NH40 331 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 LRFN3Q9BTN0 628 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 EGLN1Q9GZT9 426 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MIOXQ9UGB7 285 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TMEM218A2RU14 115 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TRILQ7L0X0 811 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TTC3P53804 2025 aa12.95□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FCN1O00602 326 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 DHHO43323 396 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FA2HQ7L5A8 372 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MOB1BQ7L9L4 216 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 C6orf201Q7Z4U5 140 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 LRRC61Q9BV99 259 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 IGHA2P01877 340 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FAM78BQ5VT40 261 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 BHLHA9Q7RTU4 235 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 M1APQ8TC57 530 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TAAR6Q96RI8 345 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 NDFIP1Q9BT67 221 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FAAP24Q9BTP7 215 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 NUP205Q92621 2012 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 A0A0B4J2E0 115 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 A0A1B0GX12 115 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FAM219AQ8IW50 185 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 OR10V1Q8NGI7 309 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SLC25A22Q9H936 323 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 AMDHD2Q9Y303 409 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SIGLEC14Q08ET2 396 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 SPINK9Q5DT21 86 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MIXL1Q9H2W2 232 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 HMSDA8MTL9 139 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 IL10RAQ13651 578 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 THSD4Q6ZMP0 1018 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TEX101Q9BY14 249 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 POMT1Q9Y6A1 747 aa12.94□□□□□ -0.34
PTPRU-204ENST00000428026 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms