RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425388.1

LINC00501-201, long intergenic non-protein coding RNA 501, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00501, Length 2,046 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF66Q6ZN08 573 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IGSF21Q96ID5 467 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 BTF3L4Q96K17 158 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MS4A10Q96PG2 267 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RARRES2Q99969 163 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 VAMP8Q9BV40 100 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TTTY10Q9BZA0 68 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR10A5Q9H207 317 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IL21Q9HBE4 155 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GPR27Q9NS67 375 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FBXO34Q9NWN3 711 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CLDND1Q9NY35 253 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 WDR45Q9Y484 360 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LIPGQ9Y5X9 500 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 COX11Q9Y6N1 276 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CDC14CA4D256 554 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 E5RGE8 158 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SAP18O00422 153 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CLEC3AO75596 197 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 NDUFB8O95169 186 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CSN2P05814 226 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GYPBP06028 91 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IRF1P10914 325 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 KLK2P20151 261 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OTX2P32243 289 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TFPI2P48307 235 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SOX2P48431 317 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PGFP49763 221 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LBX1P52954 281 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 EFEMP1Q12805 493 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FBLN7Q53RD9 439 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CLEC18BQ6UXF7 455 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SGPP2Q8IWX5 399 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 D2HGDHQ8N465 521 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR4B1Q8NGF8 309 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FAM213BQ8TBF2 198 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FGGYQ96C11 551 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR10C1Q96KK4 312 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PRSS27Q9BQR3 290 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RNF150Q9ULK6 438 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GPR132Q9UNW8 380 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 NSG2Q9Y328 171 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MED31Q9Y3C7 131 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PTGESO14684 152 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 GPR137BO60478 399 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 LEFTY1O75610 366 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 RHOCP08134 193 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 F3P13726 295 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 EGR1P18146 543 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FPR2P25090 351 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CLDN18P56856 261 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 B4GALNT1Q00973 533 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 IL11RAQ14626 422 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CCL14Q16627 93 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PRSS8Q16651 343 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ACTL10Q5JWF8 245 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 Q7L0L9 218 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CATSPERDQ86XM0 798 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 BATF2Q8N1L9 274 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ASB5Q8WWX0 329 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 KLK6Q92876 244 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CTHRC1Q96CG8 243 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PKIBQ9C010 78 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ADAM29Q9UKF5 820 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 A0A1W2PQY0 241 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 C17orf102A2RUQ5 167 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 MEGF11A6BM72 1044 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ANKUB1A6NFN9 424 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 SLC38A8A6NNN8 435 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 M0QZQ0 153 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ZNF217O75362 1048 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 NTN1O95631 604 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 FUT1P19526 365 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PTNP21246 168 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 PAFAH1B2P68402 229 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00501-201ENST00000425388 NHLH1Q02575 133 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 243.7 ms