RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CER1O95813 267 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GPANK1O95872 356 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CT45A8P0DMV1 189 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CT45A9P0DMV2 189 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PGCP20142 388 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FCGR2CP31995 323 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY1P47900 373 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CCR4P51679 360 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 QRFPP83859 136 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FUT7Q11130 342 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FAM53BQ14153 422 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PCK2Q16822 640 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MOGAT2Q3SYC2 334 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GXYLT1Q4G148 440 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 MIDNQ504T8 468 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FNDC7Q5VTL7 733 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ASPHD2Q6ICH7 369 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF529Q6P280 563 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TEPPQ6URK8 271 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FAM24BQ8N5W8 94 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR4D6Q8NGJ1 314 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF519Q8TB69 540 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 STT3BQ8TCJ2 826 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PATE1Q8WXA2 126 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 NTNG2Q96CW9 530 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC46A1Q96NT5 459 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GINS3Q9BRX5 216 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR11A1Q9GZK7 315 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC22A13Q9Y226 551 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.33□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SERPINE3A8MV23 424 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GPR137BO60478 399 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC16A7O60669 478 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PNPP00491 289 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV1-40P01703 118 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PMP2P02689 132 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PRH1P02810 166 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 H2BFMP0C1H6 154 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR8U9P0C7N5 309 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SP9P0CG40 484 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PNLIPP16233 465 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF20P17024 532 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CTSSP25774 331 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CAPZBP47756 277 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DAP3P51398 398 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM33P57088 247 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TAS2R60P59551 318 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 DCAF7P61962 342 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF616Q08AN1 781 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FOXO1Q12778 655 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HNF4GQ14541 408 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF266Q14584 549 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 IL13RA2Q14627 380 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TCEAL6Q6IPX3 200 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC35D2Q76EJ3 337 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF101Q8IZC7 436 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR8U1Q8NH10 309 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR5R1Q8NH85 324 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 M1APQ8TC57 530 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR10A5Q9H207 317 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 KCNK15Q9H427 330 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SDHAF3Q9NRP4 125 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 FBXL17Q9UF56 701 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PISDQ9UG56 409 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 TMEM131Q92545 1883 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 CACNA1EQ15878 2313 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WV48 116 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1W2PQD3 144 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 A8MVM7 634 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 AGPAT2O15120 278 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC31A2O15432 143 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RRP8O43159 456 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ADAP1O75689 374 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 BGLAPP02818 100 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPS10P46783 165 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF84P51523 738 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 P2RY4P51582 365 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 HSD17B7P56937 341 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 SLC26A5P58743 744 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 OR2B8PP59922 312 aa6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CTPS1-201ENST00000372616 EGR4Q05215 589 aa6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms