RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FAM46BQ96A09 425 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SLAMF9Q96A28 289 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PTX4Q96A99 478 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR2V2Q96R30 315 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR51I2Q9H344 312 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FN3KRPQ9HA64 309 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RHBDL2Q9NX52 303 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 EXTL2Q9UBQ6 330 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IL19Q9UHD0 177 aa10.36□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 POLEQ07864 2286 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GWJ7 208 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FABP12A6NFH5 140 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CLDN25C9JDP6 229 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CDIPTO14735 213 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CDC14BO60729 498 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IGHV1-46P01743 117 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 VSIG8P0DPA2 414 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IRF2P14316 349 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MGMTP16455 207 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ELK1P19419 428 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PITPNAQ00169 270 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF45Q02386 682 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IL18Q14116 193 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TESK1Q15569 626 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PCGF3Q3KNV8 242 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CNIH2Q6PI25 160 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OSR2Q8N2R0 312 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR51T1Q8NGJ9 327 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR11L1Q8NGX0 322 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR10K1Q8NGX5 313 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ITLN1Q8WWA0 313 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 GAL3ST1Q99999 423 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MIXL1Q9H2W2 232 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 KCNK15Q9H427 330 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 BANF2Q9H503 90 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RHOFQ9HBH0 211 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 UFSP2Q9NUQ7 469 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 IL36GQ9NZH8 169 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RABL2BQ9UNT1 228 aa10.35□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TENM4Q6N022 2769 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM14DPA8MWL7 114 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ADH4P08319 380 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CPT2P23786 658 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 PITPNBP48739 271 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MAB21L1Q13394 359 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FAM76BQ5HYJ3 339 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FAM209AQ5JX71 171 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM69Q5SWH9 247 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 OR10K2Q6IF99 312 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 RAB12Q6IQ22 244 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 C1QL2Q7Z5L3 287 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CDH24Q86UP0 819 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM200AQ86VY9 491 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 CMTM4Q8IZR5 234 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 C15orf40Q8WUR7 153 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 AQP3Q92482 292 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ERGIC1Q969X5 290 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SELENOIQ9C0D9 397 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 ABCG5Q9H222 651 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 SAP30LQ9HAJ7 183 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 C1orf123Q9NWV4 160 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FBLN5Q9UBX5 448 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 GLS2Q9UI32 602 aa10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PTPRK-201ENST00000368202 FLNCQ14315 2725 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0A6YYH2 397 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 A6NJ64 397 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 SYNGR1O43759 233 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CTAG2O75638 210 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 NXPH2O95156 264 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CLDN1O95832 211 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CHRM2P08172 466 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CD55P08174 381 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PRKACAP17612 351 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 BCL3P20749 454 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 MPZP25189 248 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PPOXP50336 477 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CCL8P80075 99 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 TLE4Q04727 773 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 PYDC2Q56P42 97 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 ASCL4Q6XD76 172 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 WDR86Q86TI4 376 aa10.33□□□□□ -0.76
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC190Q86UF4 302 aa10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms