RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF714Q96N38 554 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CDRT15Q96T59 188 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RX4Q99571 388 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 EBF4Q9BQW3 602 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NIPAL2Q9H841 368 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 YY1AP1Q9H869 796 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.27□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINE3A8MV23 424 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LEUTXA8MZ59 168 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF732B4DXR9 585 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL24O00175 119 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TK1P04183 234 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM106CPP0CH98 169 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP2K3P46734 347 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OMPP47874 163 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR3A4PP47883 348 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GPM6AP51674 278 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 EDDM3BP56851 147 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTA2P62736 377 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTG2P63267 376 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTC1P68032 377 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ACTA1P68133 377 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX30Q5JUR7 227 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL21CQ5VZV1 264 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM57BQ71RH2 274 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RTN4RL2Q86UN3 420 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC15A3Q8IY34 581 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR5A2Q8NGI9 324 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR4Q3Q8NH05 313 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DYDC1Q8WWB3 177 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SIKE1Q9BRV8 207 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52D1Q9H346 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DPM3Q9P2X0 92 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF222Q9UK12 451 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SESN1Q9Y6P5 492 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.26□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TVP23AA6NH52 213 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OOSP1A8MZH6 123 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NDUFAB1O14561 156 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TOR1AO14656 332 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FFAR1O14842 300 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GSC2O15499 205 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A17O43808 307 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 GMNNO75496 209 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 NXPH2O95156 264 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNA6P05013 189 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 H2BFMP0C1H6 154 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RHCEP18577 417 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF273Q14593 569 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TEX38Q6PEX7 206 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SHFQ7M4L6 423 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 VTCN1Q7Z7D3 282 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF573Q86YE8 665 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 C11orf42Q8N5U0 333 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 POC1AQ8NBT0 407 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DCLRE1BQ9H816 532 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 TBC1D23Q9NUY8 699 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa6.25□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 FUOMA2VDF0 154 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMD9O00233 223 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MRASO14807 208 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 IFNGP01579 166 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1B1P15313 513 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 DCTDP32321 178 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 PYCR1P32322 319 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 LUMP51884 338 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 SLX4IPQ5VYV7 408 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 CBLL1Q75N03 491 aa6.24□□□□□ -1.41
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF329Q86UD4 541 aa6.24□□□□□ -1.41
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