RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 PPIAL4EA0A075B759 164 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PPIAL4DF5H284 164 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MAGEB3O15480 346 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SYNGR1O43759 233 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ARL6IP5O75915 188 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PGA5P0DJD9 388 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PPIAL4FP0DN26 164 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 EGR1P18146 543 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZMYND11Q15326 602 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 KISS1Q15726 138 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM155Q4W5P6 130 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 HSD17B12Q53GQ0 312 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 AVPI1Q5T686 147 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 TEX36Q5VZQ5 186 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ANGPTL5Q86XS5 388 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 POC1AQ8NBT0 407 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 OR52N4Q8NGI2 321 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 REG4Q9BYZ8 158 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PPIAL4AQ9Y536 164 aa11.11□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 RNF223E7ERA6 249 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 LGALS8O00214 317 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZP1P60852 638 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF404Q494X3 552 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 FAM201AQ5SY85 155 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 DDI2Q5TDH0 399 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 RNF144BQ7Z419 303 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 CDH26Q8IXH8 852 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SPACA5Q96QH8 159 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM165Q9HC07 324 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 TCF7L1Q9HCS4 588 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 STUB1Q9UNE7 303 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ACANP16112 2415 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ABCA1O95477 2261 aa11.1□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MEGF11A6BM72 1044 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 OOEPA6NGQ2 149 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 WNT9BO14905 357 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 AKR7A2O43488 359 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 CD36P16671 472 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SRMP19623 302 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 GLRA1P23415 457 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 CD80P33681 288 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 POU3F4P49335 361 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ERVK11-1P61568 191 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SLC25A26Q70HW3 274 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 LRRTM1Q86UE6 522 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 LYPD6Q86Y78 171 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MKXQ8IYA7 352 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SAXO1Q8IYX7 474 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 SPICQ8N5J4 248 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 RFT1Q96AA3 541 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 YIPF6Q96EC8 236 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 HES4Q9HCC6 221 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 RASL12Q9NYN1 266 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.09□□□□□ -0.63
CCDC42-201ENST00000293845 ISPDA4D126 451 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF205O95201 554 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 CYB5AP00167 134 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 PLATP00750 562 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 MAS1P04201 325 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 TFAP2AP05549 437 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 CD37P11049 281 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 ADRA2CP18825 462 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 CPT2P23786 658 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 KCNJ8Q15842 424 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 DCDC5Q6ZRR9 648 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 FAM90A1Q86YD7 464 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 Q8IYB0 196 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 PXT1Q8NFP0 134 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 OR5D18Q8NGL1 313 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 OR13F1Q8NGS4 319 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 CLDND2Q8NHS1 167 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 COX4I2Q96KJ9 171 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 CEP19Q96LK0 163 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 GPER1Q99527 375 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 SLITRK2Q9H156 845 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 WDR13Q9H1Z4 485 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 OR51E2Q9H255 320 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 RHOFQ9HBH0 211 aa11.08□□□□□ -0.64
CCDC42-201ENST00000293845 SNTG1Q9NSN8 517 aa11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms