RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GTH9 108 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 MRGPREQ86SM8 312 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 TOLLIPQ9H0E2 274 aa18.83■□□□□ 0.61
CCSAP-201ENST00000284617 CT62P0C5K7 136 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MDH2P40926 338 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 RANP62826 216 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC12BQ2HXU8 276 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SIGIRRQ6IA17 410 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CBLN3Q6UW01 205 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TRILQ7L0X0 811 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MOGAT1Q96PD6 335 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 RNF24Q9Y225 148 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 M0R1X1 148 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 IGHA1P01876 353 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF32P17041 273 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FAAP24Q9BTP7 215 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CNTD2Q9H8S5 307 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MBTPS2O43462 519 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SLC24A4Q8NFF2 622 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 GPR137Q96N19 417 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 P4HTMQ9NXG6 502 aa18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 GLI3P10071 1580 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ONECUT2O95948 504 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM230Q96A57 120 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ADAM20O43506 726 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HRASP01112 189 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SEMG1P04279 462 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CTGFP29279 349 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 VMA21Q3ZAQ7 101 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 GGNBP1Q5YKI7 109 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF774Q6NX45 483 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TRAT1Q6PIZ9 186 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 C6orf201Q7Z4U5 140 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SLC35B3Q9H1N7 401 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN34H7C241 214 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NQO2P16083 231 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HOXC8P31273 242 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNRF4Q8WWF5 429 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NHSL1Q5SYE7 1610 aa18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MLF1P58340 268 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TPPP2P59282 170 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FZD5Q13467 585 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ST6GAL2Q96JF0 529 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MOGAT2Q3SYC2 334 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 GABRG3Q99928 467 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 FFAR1O14842 300 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ERVFC1-1P60608 527 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PRR27Q6MZM9 219 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 GUSBP11Q6P575 273 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR2C3Q8N628 320 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 LSMEM1Q8N8F7 131 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR5C1Q8NGR4 320 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 UCK1Q9HA47 277 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR3A4PP47883 348 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 OR6X1Q8NH79 312 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HES4Q9HCC6 221 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM9Q9Y5J7 89 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 V9GYH0 126 aa18.81■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CRYABP02511 175 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CEACAM6P40199 344 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SLC38A11Q08AI6 406 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM56Q96MV1 263 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 H3BMH7 237 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ISXQ2M1V0 245 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF426Q9BUY5 554 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 MFRPQ9BY79 579 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1W2PQD3 144 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 HSBP1O75506 76 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SRD5A2P31213 254 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ACER2Q5QJU3 275 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 PHOX2AO14813 284 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 SLC31A2O15432 143 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 CLEC9AQ6UXN8 241 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 C20orf196Q8IYI0 205 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 NUBPLQ8TB37 319 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 ACY3Q96HD9 319 aa18.8■□□□□ 0.6
CCSAP-201ENST00000284617 POMT1Q9Y6A1 747 aa18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms