RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 CRYABP02511 175 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
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GGPS1-201ENST00000282841 TMPRSS3P57727 454 aa9.47□□□□□ -0.89
GGPS1-201ENST00000282841 QRFPP83859 136 aa9.47□□□□□ -0.89
GGPS1-201ENST00000282841 GFRALQ6UXV0 394 aa9.47□□□□□ -0.89
GGPS1-201ENST00000282841 OR6F1Q8NGZ6 308 aa9.47□□□□□ -0.89
GGPS1-201ENST00000282841 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.47□□□□□ -0.89
GGPS1-201ENST00000282841 NUDT15Q9NV35 164 aa9.47□□□□□ -0.89
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GGPS1-201ENST00000282841 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
GGPS1-201ENST00000282841 FIGNL2A6NMB9 653 aa9.45□□□□□ -0.9
GGPS1-201ENST00000282841 SNAPINO95295 136 aa9.45□□□□□ -0.9
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GGPS1-201ENST00000282841 GTF2F2P13984 249 aa9.45□□□□□ -0.9
GGPS1-201ENST00000282841 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
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GGPS1-201ENST00000282841 TDGF1P3P51864 188 aa9.45□□□□□ -0.9
GGPS1-201ENST00000282841 TAF9Q16594 264 aa9.45□□□□□ -0.9
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