RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000280780.6

FAM53B-201, Transcript of family with sequence similarity 53 member B, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM53B, Length 1,568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM53B-201	ENST00000280780	AGAP6	Q5VW22	663 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	OR8S1	Q8NH09	359 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	RNF170	Q96K19	258 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		18.92	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF732	B4DXR9	585 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC17A2	O00624	439 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	PAH	P00439	452 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ADH4	P08319	380 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	HCK	P08631	526 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	PAX1	P15863	534 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	GSX2	Q9BZM3	304 aa		18.91	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	APOA1	P02647	267 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ALDOB	P05062	364 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	PRKACB	P22694	351 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	FUT6	P51993	359 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	RIN1	Q13671	783 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	SPNS3	Q6ZMD2	512 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	CDH26	Q8IXH8	852 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	RFT1	Q96AA3	541 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	MICU1	Q9BPX6	476 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ETV7	Q9Y603	341 aa		18.9	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5B21	A6NL26	309 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	SNRPB	P14678	240 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	ELK1	P19419	428 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	CD200	P41217	278 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	KISS1	Q15726	138 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	HES5	Q5TA89	166 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	CNIH2	Q6PI25	160 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	CALHM1	Q8IU99	346 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	BORCS8	Q96FH0	119 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	OR2V2	Q96R30	315 aa		18.89	■□□□□ 0.62
FAM53B-201	ENST00000280780	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	RBP2	P50120	134 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	PPOX	P50336	477 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	MTCP1	P56278	107 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	GNG3	P63215	75 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF79	Q15937	498 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	PRAMEF6	Q5VXH4	476 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	SDHC	Q99643	169 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	CCDC32	Q9BV29	185 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	OR51I2	Q9H344	312 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		18.89	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	18.89	■□□□□ 0.61
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FAM53B-201	ENST00000280780	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	IGHV4-39	P01824	125 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	CD55	P08174	381 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ZP1	P60852	638 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF154	Q13106	437 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	MPPED2	Q15777	294 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	C16orf87	Q6PH81	154 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	SPERT	Q8NA61	448 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ITLN1	Q8WWA0	313 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	SLC25A28	Q96A46	364 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	MEGF10	Q96KG7	1140 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	SRR	Q9GZT4	340 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	OR5V1	Q9UGF6	321 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	DYSF	O75923	2080 aa		18.88	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ACAN	P16112	2415 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	FABP12	A6NFH5	140 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	EIF4E	P06730	217 aa	Known RBP	18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	OR3A4P	P47883	348 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	ATP5J2	P56134	94 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	CCL8	P80075	99 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	TNFAIP6	P98066	277 aa	Predicted RBP	18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	RAB11B	Q15907	218 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		18.87	■□□□□ 0.61
FAM53B-201	ENST00000280780	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		18.87	■□□□□ 0.61

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